學(xué)術(shù)活動(dòng)報道：第十二期“協(xié)和生物醫學(xué)論壇”順利舉行
2024年3月14日下午，第十二期“協(xié)和生物醫學(xué)論壇”在可勝大樓外賓室順利舉行。應基礎所院陳厚早副所長(cháng)邀請，昌平國家實(shí)驗室任仙文教授做客本期論壇，為基礎所院廣大師生作了題為“單細胞與空間組測序數據分析算法的開(kāi)發(fā)與醫學(xué)應用”的精彩學(xué)術(shù)報告。論壇由基礎所學(xué)術(shù)活動(dòng)委員會(huì )輪值主席龍爾平教授主持，王婧書(shū)記、陳厚早副所長(cháng)等50余名科研人員、師生出席并參與討論。
任仙文教授在報告中首先介紹了為何選擇從事單細胞轉錄組測序的生物信息學(xué)分析，即用生物信息學(xué)的辦法，通過(guò)數學(xué)建模，借助計算的工具從細胞層面去研究基因型與表現型之間的函數關(guān)系，專(zhuān)注研究生物信息學(xué)，致力于開(kāi)發(fā)生物信息學(xué)方法以將單細胞測序所得的數據轉化成理解生命現象所需的信息，從而更為深刻地理解生命與疾病。接著(zhù)任教授著(zhù)重講解了其團隊開(kāi)發(fā)的一個(gè)單細胞分辨率的空間轉錄組反卷積算法——Rdeconve，該算法在各種空間轉錄組學(xué)平臺和數據集上均優(yōu)于其他算法，具有更高的準確性、分辨率、穩健性和速度，為整合單細胞與空轉數據提供了新工具，Rdeconve的出現將推動(dòng)scRNA-seq和空間轉錄組技術(shù)在各個(gè)研究方向中的應用，將全轉錄組空間轉錄組學(xué)數據與匹配的單細胞RNA測序數據一起進(jìn)行綜合分析，對生物學(xué)研究具有重要意義。
在提問(wèn)互動(dòng)環(huán)節，廣大師生積極與任仙文教授進(jìn)行交流，大家分別就Redeconve的單細胞分辨率解析提供了對免疫細胞之間相互作用的新見(jiàn)解、不同細胞類(lèi)型分辨率對反卷積的影響、Redeconve的性能與其他算法相比等問(wèn)題進(jìn)行了深入淺出的交流，與會(huì )師生受到了良好的啟發(fā)和鼓舞。