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學(xué)系與學(xué)科

生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)系介紹

學(xué)系簡(jiǎn)介

生物化學(xué)與分子生物學(xué)系的前身為原北京協(xié)和醫學(xué)院(Peking Union Medical College)生物化學(xué)系,是我國著(zhù)名的生物化學(xué)家吳憲教授于1920年組建的,并擔任首任系主任。協(xié)和生化系曾在蛋白質(zhì)變性理論、營(yíng)養學(xué)和免疫化學(xué)等研究領(lǐng)域取得了蜚聲國際的成就,并為我國近代生物化學(xué)學(xué)科的建立和發(fā)展培養了大批人才。新中國成立50余年來(lái),協(xié)和生化系逐步發(fā)展壯大,1989年、2004年連續兩次被批準為“國家高等學(xué)校重點(diǎn)學(xué)科點(diǎn)”;1991年通過(guò)論證,建立了以生化系為主體的“醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室”。本學(xué)系現已建成了以中青年科學(xué)家為骨干的科研隊伍,承擔了大量國家重要科研項目,并積極開(kāi)展國內外的學(xué)術(shù)交流與合作,擁有大量先進(jìn)的實(shí)驗儀器及設備,掌握了各種先進(jìn)的生物工程技術(shù)與方法,為我國醫學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)科研、教學(xué)和開(kāi)發(fā)做出了重要貢獻。 近50年來(lái)?yè)蜗抵魅蔚南群笥袆⑹亢馈⒘褐矙唷⑼趿辗肌姴冢辉斜姸嘀?zhù)名的教授、學(xué)者在本系工作,如劉思職、王世真、吳德昌、李士諤、王克勤、劉士廉、池芝盛、潘華珍、劉培楠、王世中、蔡良琬、胡炳晟、陸如山、于樹(shù)玉、吳冠蕓等。生化系現有職工50多人,其中正、副研究員20人,中科院院士2人,工程院院士2人,博士生導師16人,形成了以科研項目為中心的13個(gè)課題組。現任學(xué)系主任為蔣澄宇博士(自2007年6月起)。

 

歷屆主任及學(xué)科帶頭人

1924~1942,吳憲教授。1910年吳憲通過(guò)當時(shí)的庚子賠款留美考試,于1911年8月赴美留學(xué),1919年獲得哈佛醫學(xué)院生物化學(xué)博士學(xué)位。1920年春,吳憲應CMB邀請回國,參與創(chuàng )建PUMC生化系,最初任生理系助教,1921年任講師。1922年,PUMC正式成立生物化學(xué)系。1924年7月1日,吳憲晉升為副教授,并擔任生化系首任系主任(至1942年初),是當時(shí)PUMC各系中唯一的中國籍系主任。1928年吳憲晉升為教授,成為PUMC最早的中國籍三教授之一(另兩位是林可勝、劉瑞恒)。吳憲擔任系主任期間,在蛋白質(zhì)變性理論、營(yíng)養學(xué)和免疫化學(xué)等研究領(lǐng)域取得了舉世矚目的成就,共發(fā)表論文約130篇。期間,在生化系工作過(guò)的劉思職、張昌穎、林國鎬、陳同度、萬(wàn)昕、劉培楠、周啟源、鄭集、汪猷等,后來(lái)都成為我國著(zhù)名的生物化學(xué)家或營(yíng)養學(xué)家。1930~1942年,劉思職在生化系創(chuàng )造性地利用化學(xué)定量方法研究抗原-抗體的沉淀反應。1934~1941年,張昌穎在生化系參與研究“植物食品蛋白質(zhì)的提取”及“素膳的營(yíng)養性質(zhì)”兩個(gè)課題。1931~1932年間,生化系為PUMC醫本科生一年級開(kāi)設生物化學(xué)課程,年總學(xué)時(shí)數為225。

1947~1948,沈同教授。1948~1950,竇維廉(W.H.Adolph)教授。1945年9月15日,PUMC董事會(huì )和CMB從日軍手中收回全部校產(chǎn)。1947年3月,校董會(huì )任命李宗恩為校長(cháng),開(kāi)始復校準備工作。1948年10月,PUMC復校后正式開(kāi)學(xué),生化系主任由北京大學(xué)生物系沈同教授兼任(1947~1948),不久改由燕京大學(xué)化學(xué)系主任竇維廉(Adolph)擔任(1948~1950)。當時(shí)系里只有助教丁修湖、技術(shù)員洪健和1名秘書(shū)。竇維廉強調基礎與臨床結合,協(xié)和醫院的臨床血液化學(xué)室劃歸生化系。生化系繼續為醫本科生開(kāi)設生物化學(xué)課程,以Bodensky著(zhù)《生物化學(xué)》為教材。生化系招收了1名研究生(李佩珊),以及于樹(shù)玉、潘華珍、吳德昌等6名進(jìn)修生。于樹(shù)玉、潘華珍和吳德昌教授后來(lái)都成為我國著(zhù)名的生物化學(xué)基礎理論及腫瘤生物化學(xué)家,以及放射毒理與輻射防護學(xué)專(zhuān)家。

1951~1957,劉士豪教授。1951年1月,新中國教育部和衛生部接管PUMC,將協(xié)和醫院與軍委衛生部直屬中國醫院合并,改稱(chēng)“中國協(xié)和醫院”;PUMC 更名為“中國協(xié)和醫學(xué)院”。生化系主任由原協(xié)和醫院內科教授劉士豪擔任,梁植權任副主任。劉士豪重視生物化學(xué)基礎理論與臨床醫學(xué)相結合,繼早年的鈣磷代謝研究之后,50年代又在國內率先建立了各種內分泌激素測定方法。他主編了教材《生物化學(xué)與臨床醫學(xué)的聯(lián)系》(1957年出版),并于1958年在協(xié)和醫院內科學(xué)系創(chuàng )建了內分泌科

1958~1984,梁植權教授。梁植權于1950年春獲美國賓夕法尼亞州立大學(xué)生物化學(xué)系理學(xué)博士學(xué)位后,即啟程回國,在生化系任職。此時(shí)生化系稍有壯大,成員有剛從美國回來(lái)的王世真(副教授)、趙綿(副教授)和楊德馨(講師),還有方慈祺、吳德昌兩名助教。當時(shí)生化系的主要任務(wù)是給醫本科生講授生化課程和編寫(xiě)講義。科研方面,劉士豪研究血清中激素的定量測定;梁植權建立了紙電泳法,成功地用于臨床檢測血清蛋白。1960年,生化系成立生化教研室,王世中擔任主任,成員有潘華珍、陳文為、張慧影,負責醫本科生生物化學(xué)課程教學(xué),每年學(xué)時(shí)數220。按照醫大教學(xué)規劃,為培養學(xué)生獨立操作能力,1963年度生物化學(xué)講課與實(shí)驗課總學(xué)時(shí)比例應達到1:2。

1960年,中國醫學(xué)科學(xué)院舉辦了10個(gè)專(zhuān)業(yè)班,由相關(guān)的研究所分別承辦,實(shí)驗醫學(xué)研究所負責第一、二、三、五、十共5個(gè)專(zhuān)業(yè)班。學(xué)員主要選自衛生部直屬醫學(xué)院校五年制本科生,學(xué)制二年。第三專(zhuān)業(yè)班主修生化專(zhuān)業(yè),38名學(xué)員來(lái)自多所醫學(xué)院校的三年級優(yōu)秀生,胡詠梅為班主任。1962年暑期生化專(zhuān)業(yè)班畢業(yè),10名留生化系工作,即:趙敏順、繆時(shí)英、陳松森、強伯勤、崔蓮仙、陳蘭英、王明耀、楊其修、季川和劉國仰;另有王惠媛、錢(qián)家駿分配在生化教研室。他們日后均成為生化系中堅。

1984~1992,王琳芳教授。1984年,王琳芳繼梁植權之后出任系主任,副主任沈珝琲、趙敏順。1989年,國家教委批準生化系為國家“生物化學(xué)重點(diǎn)學(xué)科點(diǎn)”,王琳芳等為學(xué)科帶頭人。這一時(shí)期,生化系分為9個(gè)科研組,結構與文革前相似,后逐漸產(chǎn)生若干新的課題組,高峰時(shí)人員過(guò)百。生化系科研工作欣欣向榮,成績(jì)可觀(guān)。

1991年,國家計委批準以生化系為主體建立“醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室”(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“重點(diǎn)室”),主任王琳芳,學(xué)術(shù)委員會(huì )主任先后為顧方舟、沈珝琲。重點(diǎn)室邊建設、邊開(kāi)放,于1992年4月開(kāi)放,1993年11月通過(guò)驗收。重點(diǎn)室面積3000平方米,國家投資600萬(wàn)元(100萬(wàn)美元外匯額度),購置了大量先進(jìn)的實(shí)驗儀器設備,主要研究方向:(1)與重大疾病及細胞生物功能有關(guān)的基因結構、功能與表達;(2)與重大疾病及細胞生物功能有關(guān)基因表達調控機制。重點(diǎn)室的建立標志著(zhù)生化系的科研工作進(jìn)入了一個(gè)新的發(fā)展時(shí)期。

1992~2007,強伯勤教授。1992年12月,強伯勤接任生化系主任,副主任先后有沈珝琲、繆時(shí)英(常務(wù))、鄭德先、楊克恭(教學(xué))、許彩民、彭小忠、蔣澄宇。2002年1月,教育部再次批準生化系為“高等學(xué)校重點(diǎn)學(xué)科”,屬理學(xué)類(lèi)生物學(xué)學(xué)科,納入國家“十五”建設計劃。2002年9月,教育部和衛生部領(lǐng)導簽署了清華大學(xué)和PUMC緊密合作協(xié)議。自2003年起,PUMC的臨床醫學(xué)專(zhuān)業(yè)招生納入清華大學(xué)招生計劃,醫預科由北大轉到清華。1991~2004年,生化系的科研工作發(fā)生質(zhì)的飛躍。與90年代初相比,年均科研經(jīng)費由240萬(wàn)元增加到1188萬(wàn)元;雖發(fā)表論文總數沒(méi)有增加,但SCI收錄論文占論文總數的比例由16%增加到42%;年均培養研究生由20人增加到43人。共榮獲國家和省部級科研成果獎35項,申請專(zhuān)利8項。

2007~今,蔣澄宇教授。2007年,蔣澄宇接任生化系主任,副主任彭小忠。 目前,本學(xué)系已建成以中青年為骨干的科研隊伍,承擔大量國家重要科研項目,并積極開(kāi)展國內外的學(xué)術(shù)交流與合作,為我國醫學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教學(xué)、科研和研發(fā)做出重要貢獻。生化系設立了“王克勤生命科學(xué)獎”,并與重點(diǎn)實(shí)驗室聯(lián)合設立了“青年優(yōu)秀論文獎”“吳憲優(yōu)秀博士研究生”和“優(yōu)秀實(shí)驗記錄”。目前,學(xué)系主要承擔了八年制協(xié)和醫本科《醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座和《科研導論》課程。

 

教學(xué)工作

教學(xué)人員介紹

生化教研室成立于1993年,迄今一直由楊克恭教授負責,主要任務(wù)是安排并參與生化系的教學(xué)工作。生化系目前已培養2名專(zhuān)職教師(其中1人兼任教學(xué)秘書(shū))。簡(jiǎn)介如下:

張艷麗,2004年畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所,獲得博士學(xué)位。期間于20128月至20135月,作為訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者進(jìn)入美國杜克大學(xué)醫學(xué)中心學(xué)習,于20136月至20149月,作為訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者進(jìn)入美國Cedars-Sinai醫學(xué)中心呼吸研究所學(xué)習。工作至今,作為主講教師承擔《蛋白質(zhì)生化導論》、《核酸生化導論》、《醫學(xué)分子生物學(xué)》、《細胞生物基礎及超微結構》等課程的主要授課任務(wù)。研究方向主要為SARS冠狀病毒、流感病毒等RNA病毒及納米材料導致的急性肺損傷致病機理的研究,在基礎醫學(xué)與轉化醫學(xué)領(lǐng)域的國內外學(xué)術(shù)刊物發(fā)表第一作者的SCI論文7篇,影響因子合計38.338專(zhuān)長(cháng)于病毒導致的急性肺損傷機制,以及肺泡上皮細胞損傷與修復機制的理論與實(shí)驗研究方法,熟練掌握肺損傷小鼠模型構建、指標檢測、分子克隆、細胞培養、蛋白表達等實(shí)驗技術(shù)。近年來(lái),承擔、主要參與多項國家級課題及研究計劃。

王芳,2009年畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所,獲得博士學(xué)位,后留所擔任生物化學(xué)與分子生物學(xué)系講師一職,2012年晉升為副教授。從2009年起,擔任4門(mén)面向所院全體研究生開(kāi)設的基礎理論課程《蛋白質(zhì)生化導論》、《核酸生化導論》、《基因分子生物學(xué)原理》和《基因分子生物學(xué)》的主講教師,系統性講授生物化學(xué)與分子生物學(xué)的基本知識原理和學(xué)科的最新研究進(jìn)展。從2013年起,院校教學(xué)改革之際,順應所院研究生英文寫(xiě)作能力普遍欠缺的現狀,以課程負責人開(kāi)設《英文科技論文寫(xiě)作》課程。由于以上課程均采用國際原版教材作為參考書(shū)目,從2014年起,配合學(xué)系建立原版教材借閱制度。另一方面,也兼顧部分科研工作,主要研究方向為“非編碼RNA與造血細胞命運決定”,共發(fā)表SCI收錄論文30篇,影響因子(IF)累計160,其中在Cell Res(2011; 2017)、Nature Communication (2017)、Nucleic Acids Res(2013、2014)Oncogene(2016 JBC(2014) 等發(fā)表第一/通訊作者(含共同第一/通訊作者)論文16 篇(IF 累計約70)。上述論文被SCI 期刊引用總計700 余次,單篇最高引用230余次。主要的學(xué)術(shù)成績(jì)包括:系統性鑒定造血干細胞向紅系分化過(guò)程中的重要miRNA (JCell Biochem, 2009; J Cell Mol Med, 2009; Mol. Cells, 2014; J Biol Chem., 2014); 揭示miRNA與轉錄因子協(xié)同作用的新機制 (Nucleic Acids Res, 2013; 2014);發(fā)現紅系分化過(guò)程中的miRNA自身加工代謝與分子間互作的新機制 (Cell Res, 2011; 2016); 揭示miRNA在急性髓系白血病(AML)中的功能與作用機制(BiochemBioph Res Co. 2006;Mol Biol Rep, 2012; Blood, 2012; Cell Death and Differentiation, 2014; Oncogene, 2015; 2016);

 

學(xué)系承擔的主要課程及建設情況

學(xué)系承擔的八年制臨床醫學(xué)專(zhuān)業(yè)課程為《醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座》和《科研導論》。

    分子生物學(xué)是生命科學(xué)的帶頭學(xué)科,是基礎醫學(xué)中最活躍的前沿,其理論與技術(shù)已廣泛應用于醫學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。由于分子生物學(xué)所涉及的范圍極廣,學(xué)時(shí)有限,并且學(xué)生在醫學(xué)預科階段已經(jīng)系統學(xué)習了分子生物學(xué)的基本知識和原理。因此,我們依據分子生物學(xué)與醫學(xué)聯(lián)系最密切的領(lǐng)域,比如:?jiǎn)位蚣膊 ⒛[瘤的發(fā)生發(fā)展與診斷治療、人類(lèi)免疫缺陷綜合癥、基因工程制藥等主題,開(kāi)設《分醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座》課程。以講座形式重點(diǎn)介紹相關(guān)經(jīng)典理論、常用方法和最前沿進(jìn)展,以期為醫大學(xué)生今后學(xué)習臨床基礎理論及從事科研實(shí)驗研究打下基礎。

    另一方面,八年制醫學(xué)教育的目標是培養知識廣、基礎厚、能力強、潛力大的高端醫學(xué)人才學(xué)生不僅要具備過(guò)硬的基礎醫學(xué)知識和臨床醫療技能還要具有一定的科研思維和科研工作能力。因此,學(xué)系從八年制醫學(xué)教育的需求出發(fā),結合學(xué)系的科研優(yōu)勢,并依托醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室,邀請領(lǐng)域內取得過(guò)突出成績(jì)和作出貢獻的科研專(zhuān)家組成教學(xué)團隊,開(kāi)設《科研導論》課程,主要介紹科研理念、科研思路、以及科研經(jīng)驗和成果,為醫大學(xué)生今后從事科研實(shí)驗研究打下堅實(shí)基礎。

為保證講授的權威性和嚴謹性,我們均采用最新版的國際權威原版教材作為主要參考書(shū)目,包括:2013年出版的,H. Lodish主編的《Molecular Cell Biology》, 7thed.2013年出版的JamesD.Watson主編的《MolecularBiologyoftheGene》, 7th ed.。另一方面,由于學(xué)科自身進(jìn)展迅速的特點(diǎn),即使權威教科書(shū)中的結論也不斷受到新的科學(xué)發(fā)現的挑戰,課程授課過(guò)程中,會(huì )隨時(shí)關(guān)注和跟進(jìn)學(xué)科最新進(jìn)展,優(yōu)化教學(xué)大綱及教案,以保證將最前沿的知識傳授給學(xué)生。例如:近年來(lái),精準醫療、腫瘤免疫治療迅速興起并取得重大突破,但也存在一些不容忽視的客觀(guān)問(wèn)題,因此,爭論激烈并吸引眾多關(guān)注。為順應該領(lǐng)域研究發(fā)展趨勢,也避免即將進(jìn)入臨床一線(xiàn)的學(xué)生盲目追求新技術(shù)新方法,從2015年起《醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座》課程中特異增開(kāi)了“癌癥治療:個(gè)性化,新藥靶點(diǎn)和免疫療法”的專(zhuān)題內容,目的就是向學(xué)生介紹相關(guān)的基本原理和發(fā)展現狀,并引導學(xué)生合理預測領(lǐng)域的發(fā)展趨勢。

 

三、學(xué)系主持或參與教改情況

    學(xué)系分管教學(xué)工作的彭小忠主任,留學(xué)歸國至今一直在北京協(xié)和醫學(xué)院基礎學(xué)院從事教學(xué)科研工作,長(cháng)期教授協(xié)和八年制本科生和研究生課程,并積極推動(dòng)和促成學(xué)系的教學(xué)改革工作:從教育理念的改革入手,積極倡導雙語(yǔ)教學(xué),英文原版教材在生化系的課程中得到推廣使用;注重學(xué)生創(chuàng )新能力與實(shí)踐能力的培養,為了提高本科生和研究生的科研興趣,結合學(xué)生對科研的實(shí)際需求,組織開(kāi)設了《科研導論》課程;同時(shí)極其注重學(xué)系的教學(xué)梯隊建設和青年教師培養,大膽啟用青年教師作課程負責人和授課骨干,鼓勵他們參與嘗試教學(xué)改革。其中學(xué)系《醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座》的課程負責人許琪研究員結合自身特長(cháng),以及課程需求,申請并承擔校級教改項目一項:“神經(jīng)系統疾病基礎與臨床”。學(xué)系的彭小忠老師,分別榮獲2016年“北京協(xié)和醫學(xué)院教學(xué)名師”稱(chēng)號,和2016年“所院優(yōu)秀學(xué)科帶頭人”稱(chēng)號;許琪老師分別榮獲霍英東教育基金會(huì )和教育部的“第十一屆高等院校青年教師獎”,入選“第六批北京市優(yōu)秀青年知識分子”。

 

特色教學(xué)工作

    生物化學(xué)與分子生物學(xué)系以醫學(xué)分子生物學(xué)國家實(shí)驗室為依托,總體定位以國家重大需求為導向,立足于醫學(xué)前沿,充分發(fā)揮臨床優(yōu)勢,多學(xué)科交叉融合協(xié)同創(chuàng )新,以“圍繞重大疾病,闡釋分子機理,促進(jìn)臨床轉化”的創(chuàng )新鏈條支撐健康中國建設。成為科學(xué)研究與技術(shù)創(chuàng )新平臺、國際合作與交流學(xué)術(shù)中心、培養高層次創(chuàng )新人才高地,引領(lǐng)國內基礎醫學(xué)發(fā)展方向。

年制醫學(xué)教育的目標是培養知識廣、基礎厚、能力強、潛力大的高端醫學(xué)人才學(xué)生不僅要具備過(guò)硬的基礎醫學(xué)知識和臨床醫療技能還要具有一定的科研思維和科研工作能力,尤其需要掌握基本的醫學(xué)分子生物學(xué)知識和進(jìn)展,為今后從事醫學(xué)科學(xué)研究奠定堅實(shí)基礎生物化學(xué)與分子生物學(xué)系的研究正不斷結合國際醫學(xué)生物學(xué)的前沿研究進(jìn)展,高度重視國家對人口與健康的需求,充分利用本學(xué)科的研究基礎與特點(diǎn),探討與重大疾病及細胞重要生物功能相關(guān)的基因/蛋白質(zhì)的結構、功能及其表達調控信號傳遞,在分子與細胞水平上闡述重要生命活動(dòng)的分子機制,闡述重大疾病的發(fā)生、發(fā)展規律與機理,為疾病的防治提供理論依據和實(shí)際指導;推進(jìn)轉化醫學(xué)研究,加快研究成果轉化,為國民經(jīng)濟發(fā)展和人類(lèi)健康服務(wù)。生物化學(xué)與分子生物學(xué)系依據學(xué)科特點(diǎn),充分發(fā)揮學(xué)科科研優(yōu)勢,側重培養學(xué)生的醫學(xué)科學(xué)研究能力,形成了具有學(xué)科特色的教學(xué)體系:

1. 為使學(xué)生近距離領(lǐng)略大師風(fēng)采,本科生的課程加入“院士進(jìn)講堂”環(huán)節:其中醫學(xué)分子生物學(xué)前沿進(jìn)展講座》課程有強伯勤院士、劉德培院士?jì)晌辉菏繀⑴c授課;《科研導論》課程有曹雪濤院士、劉德培院士和沈巖院士三位院士參與授課。

2. 立足學(xué)生早期接觸科研,開(kāi)設《科研導論》課程。授課隊伍分別由院士、教授、臨床專(zhuān)家、師兄師姐組成,他們分別從不同角度介紹自己的科研經(jīng)歷和科研體會(huì ),幫助學(xué)生深刻理解科研工作;授課內容也是以科研方法論結合科研實(shí)例的展示,從理論和方法學(xué)上給予學(xué)生對科研全面的了解和接觸。課程中間還穿插了組會(huì )觀(guān)摩和重點(diǎn)實(shí)驗室參觀(guān)活動(dòng),使學(xué)生近距離接觸一線(xiàn)科研工作者,并與他們交流切身的心得體會(huì )。

3. 學(xué)系每?jì)赡昱e辦的“吳憲吳瑞國際學(xué)術(shù)研討會(huì )”為學(xué)生提供了開(kāi)闊國際化視野的機會(huì )。為了促進(jìn)國內的醫學(xué)研究者及時(shí)了解生物化學(xué)與分子生物學(xué)發(fā)展的方向、掌握最新的研究成果、推動(dòng)國內外研究生物化學(xué)與分子生物學(xué)的同仁能更有效的進(jìn)行交流和合作、同時(shí)也為了紀念吳憲和吳瑞教授對生命醫學(xué)研究的杰出貢獻、推進(jìn)國際學(xué)術(shù)交流,生化系每?jì)赡曛鬓k的“吳憲吳瑞國際學(xué)術(shù)研討會(huì )”已連續召開(kāi)了五屆。每年以不同主題,邀請國際上相關(guān)領(lǐng)域知名專(zhuān)家學(xué)者與會(huì ),其中不乏眾多諾貝爾獎得主。本科生可免費參會(huì ),據統計每屆參會(huì )本科生20~30人左右。

 

各課題組科研工作

1、  王琳芳/宋偉課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

生殖細胞的發(fā)生及其基因表達是生命進(jìn)化中獲得的一組特定的功能,受到嚴格的時(shí)空調控。研究組以雄性生殖細胞為對象,應用現代分子生物學(xué)與細胞生物學(xué)方法,從細胞水平到整體水平,研究其發(fā)生發(fā)展過(guò)程中程序表達的基因/蛋白質(zhì)的結構與功能,以期科學(xué)地認識精子發(fā)生的分子機制,同時(shí)探索與某些重大疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系。
  課題組多次承擔國家863、973、重大科學(xué)研究計劃、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)、面上、博士點(diǎn)基金和中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所院(所)長(cháng)基金等課題。八十年代以來(lái),采用基因篩選、LCM、DDRT-PCR等技術(shù),自人和大鼠睪丸發(fā)現了約50個(gè)精子發(fā)生特異的新基因,擁有自主知識產(chǎn)權。對其中數個(gè)基因的基因結構、表達規律、選擇性剪接等都進(jìn)行了較深入的研究,對其編碼蛋白質(zhì)開(kāi)展了三維結構及初步的功能研究,發(fā)現它們分別與生精細胞的一些重要功能密切相關(guān)(如細胞分裂紡錘體的形成、細胞周期和細胞凋亡、胞內囊泡轉運頂體形成、核質(zhì)轉運、信號傳導等),是構成精子發(fā)生信息流網(wǎng)絡(luò )的重要分子。今后將進(jìn)一步應用和建立多種技術(shù)平臺,包括基因沉默、基因敲除、基因插入及體內外生精重塑等,揭示精子蛋白質(zhì)在生精細胞有絲分裂、凋亡、減數分裂和變形幾個(gè)重要事件中的作用機制及其與一些重大疾病如腫瘤等發(fā)生的關(guān)系,為人類(lèi)的生殖健康服務(wù)

 

2. 課題組負責人介紹

王琳芳教授中國工程院院士,博士生導師,1959年原北京協(xié)和醫學(xué)院生化系研究生畢業(yè)。1960年至1961年赴前蘇聯(lián)莫斯科大科學(xué)院進(jìn)修,回國后于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究室工作至今。1981-1983年獲美國洛克菲勒基金會(huì )博士后獎學(xué)金,于紐約洛克菲勒大學(xué)生物醫學(xué)研究中心從事生殖生物學(xué)研究。1986-1992 年獲美國洛氏基金會(huì )“Biotechnology Career Fellowship”每年赴美3 個(gè)月從事科研工作。

1984-1992年任生物化學(xué)與分子生物學(xué)系系主任。1992年至2004年任醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室主任,先后被選為中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì )常務(wù)理事(三屆),中國醫學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )主任(兩屆),北京生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì )理事長(cháng)(一屆)。現任醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室名譽(yù)主任,基礎醫學(xué)研究所學(xué)術(shù)委員會(huì )副主任,協(xié)和醫大基礎II學(xué)位分委會(huì )主席,中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)雜志副主編等職。
  長(cháng)期致力于蛋白質(zhì)結構與抗原性關(guān)系的研究。60年代參與領(lǐng)導創(chuàng )制兩種戰備需要的動(dòng)物血清代血漿;70年代開(kāi)展針刺麻醉的分子基礎的探索; 1978年后組織領(lǐng)導生殖生物學(xué)研究,對精子蛋白質(zhì)的純化,結構功能及其基因克隆與表達進(jìn)行了系統性的研究,于國內率先開(kāi)展精子蛋白質(zhì)基因在轉錄與翻譯水平的基因表達研究,該工作獲得1993年國家衛生部科學(xué)技術(shù)進(jìn)步一等獎,1995年國家自然科學(xué)二等獎。1995年獲得吳憲教授稱(chēng)號。1996年獲光華科技基金獎一等獎。1997年當選為中國工程院院士。迄今發(fā)表論著(zhù)百余篇。培養理學(xué)博士和醫學(xué)博士百余名。

宋偉副研究員,博士生導師,中國生理學(xué)會(huì )生殖科學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員、北京市生化學(xué)會(huì )青年委員會(huì )委員。師從中國工程院院士王琳芳。作為課題負責人承擔國家科技支撐計劃項目課題1項,國家自然科學(xué)基金青年基金項目1項和面上項目2項,所院基金項目2項,參加醫科院協(xié)同創(chuàng )新團隊項目1項,并作為課題骨干先后參加4項國家973項目課題的研究工作。2012年獲得中國醫學(xué)科學(xué)院&北京協(xié)和醫學(xué)院“協(xié)和新星”稱(chēng)號。2016年獲得中國醫學(xué)科學(xué)院&北京協(xié)和醫學(xué)院“青年創(chuàng )新獎”。申請國家發(fā)明專(zhuān)利5項,獲得專(zhuān)利授權1項(第一發(fā)明人)。目前在Nature CommunicationsCell ResearchCellular and Molecular Life SciencesCellNucleic Acids Research等雜志發(fā)表研究論文30余篇,其中SCI論文25篇,累計影響因子超過(guò)150分。

 

3. 課題組成員介紹

繆時(shí)英教授1962年畢業(yè)于上海第二醫學(xué)院,分配至中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化系工作至今。現任中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì )醫學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)分會(huì )秘書(shū)長(cháng),北京生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì )秘書(shū)長(cháng)。長(cháng)期從事蛋白質(zhì)結構與功能研究,自1979年始進(jìn)入精子膜蛋白的分子生物學(xué)領(lǐng)域,開(kāi)展蛋白質(zhì)分離、純化及其編碼基因的克隆表達和結構與功能的研究。先后承擔或主持了國家自然科學(xué)基金、“七五”攻關(guān)、國家教委、衛生部等多項課題。八五、九五期間為國家“863”課題負責人。1999年起承擔國家“973”項目,為子項目負責人。作為主要研究人員之一,獲得1993年國家衛生部科學(xué)技術(shù)進(jìn)步一等獎,1995年國家自然科學(xué)二等獎。

李凱助理研究員20069月至20106月,畢業(yè)于河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè),并獲理學(xué)學(xué)士學(xué)位。20109月至20136月,畢業(yè)于北京協(xié)和醫學(xué)院阜外心血管病醫院生物化學(xué)與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè),并獲理學(xué)碩士學(xué)位。20139月至20166月,畢業(yè)于北京協(xié)和醫學(xué)院基礎學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè),并獲理學(xué)博士學(xué)位。研究方向為長(cháng)非編碼RNARNA結合蛋白質(zhì)在精子發(fā)生中的功能及機制研究。利用高通量測序技術(shù)鑒定精子發(fā)生過(guò)程中 lncRNA 及其相互作用復合體,建立其動(dòng)態(tài)調控網(wǎng)絡(luò ),并解析核心lncRNA在精子發(fā)生中的功能及作用機制;承擔北京協(xié)和醫學(xué)院“協(xié)和青年科研基金”1項,參加醫科院“創(chuàng )新工程項目”1項,參加科技部“國家重大科學(xué)研究計劃”1項,參加國家自然科學(xué)基金委“面上項目”1項。

 

4. 課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

Rhomboid家族新成員RHBDD1在腫瘤發(fā)生中的機制研究

院所長(cháng)基金

2010-2011

2010

2011

2

減數分裂中DNA重組、修復及穩定性

973

 

2011

2012

3

/母源性生殖障礙誘發(fā)胚胎源性疾病風(fēng)險評估及機制研究

973

 

2012

2013

4

跨膜絲氨酸蛋白酶RHBDD1在結直腸癌發(fā)生中的功能研究

博士點(diǎn)基金

 

2012

2014

5

睪丸特異表達泛素連接酶RNF138在精子發(fā)生中的功能研究

博士點(diǎn)基金

 

2012

2014

6

男用避孕方法的研究

支撐計劃

 

2012

2015

7

減數分裂中DNA重組、修復及穩定性

973

 

2013

2015

8

Rhomboid家族新成員RHBDD1作為結直腸癌肝轉移新分子標志物的研究

北京協(xié)和醫學(xué)院“協(xié)和青年基金”

 

2013

2014

9

膜內絲氨酸蛋白酶RHBDD1通過(guò)表皮生長(cháng)因子受體家族促進(jìn)結直腸癌肝臟轉移的機制研究

自然基金

 

2014

2017

10

/母源性生殖障礙誘發(fā)胚胎源性疾病風(fēng)險評估及機制研究

973

 

2014

2016

11

精子發(fā)生中LncRNA及互作復合體表達的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò )

973

 

2015

2019

12

膠原蛋白酶ADAMTS2在精子發(fā)生中的功能研究

自然青年基金

 

2015

2017

13

膜內絲氨酸蛋白酶RHBDD1在結直腸癌的靶向與聯(lián)合靶向治療研究

自然青年基金

 

2016

2018

14

泛素連接酶RNF138抑制結直腸炎癥-癌癥轉化的分子機制研究

自然基金

 

2017

2020

15

腫瘤驅動(dòng)基因分子分型與個(gè)體化治療研究

 

院創(chuàng )新工程

 

2016

2020

16

干細胞異質(zhì)性的表觀(guān)遺傳調控機理

院創(chuàng )新工程

 

2017

2021

 

5. 課題組近5年代表性論文

(1)Fang Wang, Wei Song, Hongmei Zhao, et al. The RNA-binding protein QKI5 regulates primary miR-124-1 processing via a distal RNA motif during erythropoiesis. Cell Research, 2017, 27(3): 416-439.

(2)Longchang Xu, Yalan Lu, Deqiang Han, et al. Rnf138 promotes the proliferation of spermatogonia in juvenile male mice. Cell Death and Disease,2017,8, e2795

(3)Fei Miao, Mengmeng Zhang,et al. RHBDD1 upregulates EGFR via the AP-1 pathway in colorectal cancer. Oncotarget,2017,8(15): 25251-25260

(4)Ruiqin Han, Qing Zhao, Shudong Zong,et al. A Novel TRIM Family Member, Trim69, Regulates Zebrafish Development Through p53-Mediated Apoptosis. Molecular Reproduction & Development,2016,82:1-13

(5)Jun Fu, Rongyan Yao, Yanyun Luo, et al.Anti-GAPDHS antibodies: a biomarker of immune Infertility. Cell Tissue Res,2016,364:199–207

(6)Deqiang Han, Junbo Liang, Yalan Lu,et al.Ubiquitylation of Rad51d Mediated by E3 Ligase Rnf138 Promotes the Homologous Recombination Repair Pathway. PLOS ONE,2016,11(5):e0155476.

(7)Ruiqin Han,Renxian Wang,Qing Zhao, et al. Trim69 regulates zebrafish brain development by ap-1 pathway.Scientific Reports,2016,6:24034

(8)Yanchuan Li, Hui Wang, Xiaofei Zhou, et al. Cell intrinsic role of NF-κB-inducing kinase in regulating T cell-mediated immune and autoimmune responses. Scientific Reports,2016,6:22115

(9)Jun Fu, Rongyan Yao. Yanyun Luo, et al. Immune Inrertility Should Be Positively Diagnosed UUsing an Accurate Method by Monitoring the Level of Anti-ACTL7a Antibody. Scientific Reports,2016,6:22844

(10)Wei Song,Wenjie Liu,Hong Zhao,et al.Rhomboid Domain Containing 1  (RHBDD1)  Promotes  Colorectal Cancer Growth through Activation of the EGFR Signaling Pathway. Nature Communications,2015,6:8022,1-13

(11)Yang Li, Han Wu, Wei Wu, et al. Structural insights into the TRIM family of ubiquitin E3 ligases. Cell Research,2014,24(6):762-765

(12)Shan Lu, Renxian Wang, Congli Cai, et al. Small Kinetochore Associated Protein (SKAP) promotes UV-induced cell apoptosis through negatively regulating Pre-mRNA processing Factor 19 (Prp19). PLoS One,2014,9(4)e92712

(13)Zebin Huang, Shangze Li, Wei Song, et al. Lysine-Specific Demethylase 1 (LSD1/KDM1A) Contributes to Colorectal Tumorigenesis via Activation of the Wnt/B-Catenin Pathway by Down-Regulating Dickkopf-1 (DKK1). PLoS One,2013,8(7)e70077

(14)Xiaoxia Ren, Wei Song , Wenjie Liu,et al.Rhomboid domain containing 1 inhibits cell apoptosis by upregulating AP-1 activity and its downstream target Bcl-3. FEBS Letters,2013,587: 1793-1798

(15)Min-xian Qian, Ye Pang, Cui-hua Liu, et al. Acetylation-Mediated proteasomal degradation of core histones during DNA repair and spermatogenesis. Cell,2013,153:1012-1024

(16)Jun Fu, Wei Song, Shudong Zong, et al.Dynamic alterations in the expression and localization of ACTL7a during capacitation in mouse spermatozoa. Fertility and sterility,2013,993:882-888

(17)Xiaolu Li, Wei Zhuo,Jie Yu,et al. Structure of the nucleotide-binding domain of a dipeptide ABC transporter reveals a novel iron–sulfur cluster-binding domain. Acta Cryst,2013,D69: 256–265

(18)Yongqing Han, Rong Li, Jinlan Gao, et al. Characterization of human RING finger protein TRIM69, a novel testis E3 ubiquitin ligase and its subcellular localisation. BBRC,2012,429:6-11

(19)Hong Zhao, Qinshan Li, Jian Wang, et al.Frequent epigenetic silencing of the folate-metabolising gene cystathionine-beta-synthase in gastrointestinal cancer. PLoS ONE,2012,7(11): e49683

(20)Wei Wu, Wei Song, Shuchun Li, et al. Regulation of apoptosis by Bat3-enhanced YWK-II protein/APLP2 stability. J. Cell  Sciences,2012,125(18):4219-4229

 

6. 課題組近5年專(zhuān)利

(1)源自RHBDD1的蛋白及其在制備用于檢測結直腸癌或乳腺癌的單克隆抗體中的用途 (201110310766.6) 

(2)檢測RHBDD1蛋白的ELISA方法及試劑盒(201610979636.4) 

(3)一種重組人白血病抑制因子的制備方法(201610642110.7) 

(4)抗ACTL7a和GAPDH-2抗體的檢測方法、試劑盒極其用途(201510164713.6) 

(5)一種源自ARID2的抗原表位及其在抗體制備中的用途(201611060796.5)

 

2、 劉德培課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

課題組近年來(lái)先后承擔國家自然科學(xué)基金重大項目珠蛋白基因表達的時(shí)空順序性研究、基因表達的調控網(wǎng)絡(luò )研究、國家杰出青年科學(xué)基金、科技部“九五”攻關(guān)項目人類(lèi)疾病動(dòng)物模型的建立、國家863重點(diǎn)項目雜合寡核苷酸介導的基因定點(diǎn)修復與疾病的基因治療、科技部863重點(diǎn)項目地中海貧血基因治療、國家973項目疾病來(lái)源iPS 的表觀(guān)調控與突變基因定點(diǎn)修復研究等項目。主持心血管疾病973項目“重大血管性疾病發(fā)病機制和防治的基礎研究”,“動(dòng)脈粥樣硬化發(fā)病機制及其診治與干預的基礎研究”,并獲得自然基金委創(chuàng )新群體的榮譽(yù)稱(chēng)號。課題組一共畢業(yè)博士生80多人,在讀博士研究生20人,出站博士后3人,在讀博士后2人。
   課題組學(xué)術(shù)氣氛活躍,注重交流,分別與約翰霍普金斯、哈佛、港大等相關(guān)實(shí)驗室建立了長(cháng)期穩定的合作關(guān)系。課題組堅持以人為本,鼓勵創(chuàng )新,充分發(fā)揮每個(gè)人的聰明才智,大家以誠相見(jiàn),做到和而不同,為而不爭,在這種寬松的學(xué)術(shù)環(huán)境中從事科學(xué)研究。

 

2. 課題組負責人介紹

劉德培研究員,中國工程院院士,博士生導師1950年5月生,1986年獲中國協(xié)和醫科大學(xué)博士學(xué)位,1987-1990年美國加州大學(xué)舊金山分校博士后,1990年回協(xié)和基礎所工作,1991年被授予“做出突出貢獻的中國博士學(xué)位獲得者”稱(chēng)號,1993年被評為“全國首屆中青年醫學(xué)科技之星”,1994年被評為國家級有突出貢獻的中青年專(zhuān)家,入選原國家教委“跨世紀優(yōu)秀人才培養計劃”,獲國家教委跨世紀優(yōu)秀人才基金,獲國家自然科學(xué)基金委優(yōu)秀中青年人才基金,1995年獲國家自然科學(xué)基金委杰出青年科學(xué)基金,被評為求是基金會(huì )杰出青年學(xué)者。1996年當選中國工程院院士,2008年當選為美國醫學(xué)科學(xué)院(IOM)與第三世界科學(xué)院(TWAS)院士,2016年當選為國際醫學(xué)科學(xué)院(IAPH)組織共同主席。先后承擔國家自然科學(xué)基金重大、重點(diǎn)項目、國家863重點(diǎn)項目等,國家自然科學(xué)基金委“優(yōu)秀創(chuàng )新群體”學(xué)術(shù)帶頭人,心血管973項目首席科學(xué)家。獲得衛生部科技進(jìn)步獎、北京市科技進(jìn)步獎、中華醫學(xué)科技獎、國家自然科學(xué)獎。現任醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室主任,中華醫學(xué)會(huì )副會(huì )長(cháng),中華醫學(xué)雜志副主編,JMM雜志副主編。擔任中國生化與分子生物學(xué)脂質(zhì)與脂蛋白專(zhuān)業(yè)委員會(huì )主任委員,中國生化與分子生物學(xué)醫學(xué)生物化學(xué)委員會(huì )理事長(cháng)。

 

3. 課題組成員介紹

陳厚早研究員男,1978年2月出生。北京協(xié)和醫學(xué)院生化與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)博士。2011年任中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所副研究員,2013年破格為博士生導師。現任中國生化與分子生物學(xué)脂質(zhì)與脂蛋白青年委員會(huì )副主任委員,中國老年學(xué)和老年醫學(xué)學(xué)會(huì )抗衰老委員會(huì )委員等。

張祝琴博士男,助理研究員

郝德龍:男,主管技師,本科
 

4. 課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

代謝與能量失衡在重大疾病發(fā)生發(fā)展中的研究

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新項目

160萬(wàn)元

2017

2020

2

心血管疾病的表觀(guān)遺傳機制研究

國家自然基金優(yōu)秀青年科學(xué)基金項目

100萬(wàn)元

2015

2017

3

SIRT2在血管緊張素II誘導的心肌肥厚中的作用及其機制

醫科院-中央高校基本科研業(yè)務(wù)費

50萬(wàn)元

2017

2017

4

萬(wàn)人計劃青年拔尖人才經(jīng)費

中共中央組織部機關(guān)事務(wù)管理局

180萬(wàn)元

2015

2017

5

衰老相關(guān)的重大血管疾病表觀(guān)機制研究

基地平臺建設-基本科研業(yè)務(wù)費

160萬(wàn)元

2017

2018

6

地中海貧血治療研究

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程服務(wù)“一帶一路”戰略先導科研專(zhuān)項

100萬(wàn)元

2017

2020

7

小檗堿對心血管疾病的防治作用與分子基礎

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新項目

50萬(wàn)元

2017

2020

8

心肌病全景圖和心力衰竭綜合干預研究

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新項目

50萬(wàn)元

2017

2020

9

血管損傷新模型的建立和研發(fā)

國家自然基金重大研究計劃

140萬(wàn)元

2017

2019

10

內源性Mic60蛋白在心肌肥厚和心力衰竭中作用以及機制研究

國家自然基金-面上項目

75.28萬(wàn)元

2016

2019

11

心血管疾病相關(guān)基因的大鼠基因剔除模型建立

國家科技支撐計劃項目

120萬(wàn)元

2015

2017

12

基因工程大鼠模型的研發(fā)與示范

國家科技支撐計劃項目

210萬(wàn)元

2014

2017

13

超高分辨率PET的開(kāi)發(fā)和應用

國家重大科學(xué)儀器設備開(kāi)發(fā)專(zhuān)項

300萬(wàn)元

2013

2017

14

能量限制保護血管穩態(tài)的表觀(guān)遺傳機制研究

國家自然基金重點(diǎn)支持項目

265萬(wàn)元

2014

2017

 

5. 課題組近5年代表性論文

(1) Liu Y, Wang TT, Zhang R, Fu WY, Wang X, Wang F, Gao P, Ding YN, Xie Y, Hao DL, Chen HZ, Liu DP. Calorie restriction protects against experimental abdominal aortic aneurysms in mice. J Exp Med 2016;213:2473-2488.

(2) Chen HZ, Wang F, Gao P, Pei JF, Liu Y, Xu TT, Tang X, Fu WY, Lu J, Yan YF, Wang XM, Han L, Zhang ZQ, Zhang R, Zou MH, Liu DP. Age-Associated Sirtuin 1 Reduction in Vascular Smooth Muscle Links Vascular Senescence and Inflammation to Abdominal Aortic Aneurysm. Circ Res 2016;119:1076-1088.

(3) Zhang R, Chen HZ, Liu DP. The Four Layers of Aging. Cell Syst 2015;1:180-186.

(4) Luo YX, Tang X, An XZ, Xie XM, Chen XF, Zhao X, Hao DL, Chen HZ, Liu DP. Sirt4 accelerates Ang II-induced pathological cardiac hypertrophy by inhibiting manganese superoxide dismutase activity. Eur Heart J 2016.

(5) Zhang ZQ, Ren SC, Tan Y, Li ZZ, Tang X, Wang TT, Hao DL, Zhao X, Chen HZ, Liu DP. Epigenetic regulation of NKG2D ligands is involved in exacerbated atherosclerosis development in Sirt6 heterozygous mice. Sci Rep 2016;6:23912.

(6) Xu P, Tong Y, Liu XZ, Wang TT, Cheng L, Wang BY, Lv X, Huang Y, Liu DP. Both TALENs and CRISPR/Cas9 directly target the HBB IVS2-654 (C > T) mutation in beta-thalassemia-derived iPSCs. Sci Rep 2015;5:12065.

(7) Mu WL, Wang YJ, Xu P, Hao DL, Liu XZ, Wang TT, Chen F, Chen HZ, Lv X, Liu DP. Sox2 Deacetylation by Sirt1 Is Involved in Mouse Somatic Reprogramming. Stem Cells 2015;33:2135-2147.

(8) Zhang SM, Zhu LH, Chen HZ, Zhang R, Zhang P, Jiang DS, Gao L, Tian S, Wang L, Zhang Y, Wang PX, Zhang XF, Zhang XD, Liu DP, Li H. Interferon regulatory factor 9 is critical for neointima formation following vascular injury. Nat Commun 2014;5:5160.

(9) Chen HZ, Guo S, Li ZZ, Lu Y, Jiang DS, Zhang R, Lei H, Gao L, Zhang X, Zhang Y, Wang L, Zhu LH, Xiang M, Zhou Y, Wan Q, Dong H, Liu DP, Li H. A critical role for interferon regulatory factor 9 in cerebral ischemic stroke. J Neurosci 2014;34:11897-11912.

(10) Wang PX, Zhang R, Huang L, Zhu LH, Jiang DS, Chen HZ, Zhang Y, Tian S, Zhang XF, Zhang XD, Liu DP, Li H. Interferon regulatory factor 9 is a key mediator of hepatic ischemia/reperfusion injury. J Hepatol 2015;62:111-120.

(11) Wan YZ, Gao P, Zhou S, Zhang ZQ, Hao DL, Lian LS, Li YJ, Chen HZ, Liu DP. SIRT1-mediated epigenetic downregulation of plasminogen activator inhibitor-1 prevents vascular endothelial replicative senescence. Aging Cell 2014;13:890-899.

(12) Wu J, Zhou LQ, Yu W, Zhao ZG, Xie XM, Wang WT, Xiong J, Li M, Xue Z, Wang X, Zhang P, Mao BB, Hao DL, Lv X, Liu DP. PML4 facilitates erythroid differentiation by enhancing the transcriptional activity of GATA-1. Blood 2014;123:261-270.

(13) Chen HZ, Wan YZ, Liu DP. Cross-talk between SIRT1 and p66Shc in vascular diseases. Trends Cardiovasc Med 2013;23:237-241.

(14) Xue Z, Lv X, Song W, Wang X, Zhao GN, Wang WT, Xiong J, Mao BB, Yu W, Yang B, Wu J, Zhou LQ, Hao DL, Dong WJ, Liu DP, Liang CC. SIRT1 deacetylates SATB1 to facilitate MAR HS2-MAR epsilon interaction and promote epsilon-globin expression. Nucleic Acids Res 2012;40:4804-4815.

(15) Zhou S, Chen HZ, Wan YZ, Zhang QJ, Wei YS, Huang S, Liu JJ, Lu YB, Zhang ZQ, Yang RF, Zhang R, Cai H, Liu DP, Liang CC. Repression of P66Shc expression by SIRT1 contributes to the prevention of hyperglycemia-induced endothelial dysfunction. Circ Res 2011;109:639-648.

(16) Lu L, Li L, Lv X, Wu XS, Liu DP, Liang CC. Modulations of hMOF autoacetylation by SIRT1 regulate hMOF recruitment and activities on the chromatin. Cell Res 2011;21:1182-1195.

(17) Li L, Zhang HN, Chen HZ, Gao P, Zhu LH, Li HL, Lv X, Zhang QJ, Zhang R, Wang Z, She ZG, Wei YS, Du GH, Liu DP, Liang CC. SIRT1 acts as a modulator of neointima formation following vascular injury in mice. Circ Res 2011;108:1180-1189.

(18) Li ZY, Xi Y, Zhu WN, Zeng C, Zhang ZQ, Guo ZC, Hao DL, Liu G, Feng L, Chen HZ, Chen F, Lv X, Liu DP, Liang CC. Positive regulation of hepatic miR-122 expression by HNF4alpha. J Hepatol 2011;55:602-611.

 

6. 課題組近5年專(zhuān)利

(1)劉德培,陳厚早,王放。三羥基黃酮在制備用于治療或預防腹主動(dòng)脈瘤的藥物中的用途。ZL201410184290.X

(2)劉德培,宋崴,薛征,汪星,呂湘。SIRT1在制備上調珠蛋白基因表達及在制備治療貧血藥物中的用途。ZL200910180474.8

(3)劉德培,陳鋒,李家亮,徐珍,呂湘,梁植權。同時(shí)表達抗原特異性受體和外源基因的重組逆轉錄病毒載體、用其修飾的B淋巴細胞及其用途。ZL200910085463.1

(4)劉德培,梁植權,孫立紅,肖培根,楊瑞鋒,陳厚早,張媛,劉光。IMMT基因敲除鼠的培育方法及該小鼠模型的用途。ZL201010186473.7

(5)劉德培,周爽,陳厚早,萬(wàn)言珍。SIRT1在制備預防內皮細胞功能失常導致的疾病的藥物中的用途。ZL201010512403.6

 

三、沈巖、許琪課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

課題組主要從事重性腦疾病致病/易感基因的識別及相應功能學(xué)研究。課題組主要研究精神分裂癥、重性抑郁癥、癲癇、阿爾茲海默病(老年癡呆癥)等重性精神神經(jīng)疾病的發(fā)病機制。目前課題組的研究方向主要包括:1)尋找疾病的易感基因和生物標志物;2)闡述疾病發(fā)病的分子病理機制;3)探索疾病的治療靶點(diǎn)。我們的興趣在于探索和應用新的研究策略和方法:1)發(fā)現疾病的易感基因,并深入研究易感基因間的作用模式;2)利用先進(jìn)的神經(jīng)生物學(xué)研究方法,闡明易感基因如何參與到疾病的病理生理進(jìn)程中;3)挖掘可用于診斷或治療的生物標志物;4)解釋精神疾病與其它疾病共病現象;5)理解精神神經(jīng)疾病中基因與環(huán)境相互作用機理;6)針對靶基因開(kāi)發(fā)基于病毒載體或新型藥物的治療方法。
    課題組現有先進(jìn)的神經(jīng)科學(xué)研究平臺,經(jīng)驗豐富的帶教老師,可以為碩士/博士研究生提供合理完善的培養計劃。

 

2.課題組負責人介紹

沈巖研究員,男,1951年10月19日出生,分子遺傳學(xué)家,全國人大代表,中國科學(xué)院院士。在單基因遺傳病和多基因復雜疾病發(fā)病分子機理研究等領(lǐng)域均有重要貢獻。現任國家自然科學(xué)基金委員會(huì )副主任,中國科協(xié)副主席,中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所研究員、博士生導師。
    1969年1月至1979年3月,陜西省延安縣插隊知青/赤腳醫生;1979年6月至1980年11月,北京市農科院畜牧獸醫研究所實(shí)驗工;1980年12月至今,中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所技工、技師、實(shí)習研究員、助理研究員、副研究員、研究員、博士生導師。1980年至1984年于北京市職工大學(xué)(業(yè)余大學(xué))環(huán)境工程專(zhuān)業(yè)學(xué)習(大專(zhuān)學(xué)歷),1987年至1989年于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所/中國協(xié)和醫科大學(xué)在職申請碩士學(xué)位,獲生化專(zhuān)業(yè)理學(xué)碩士學(xué)位。2003年當選中國科學(xué)院院士。2005年獲何梁何利科技進(jìn)步獎,2007年獲全國五一勞動(dòng)獎?wù)隆V饕獜氖氯祟?lèi)遺傳疾病基因識別、DNA診斷和疾病分子機理研究。
    在單基因遺傳病研究方面,通過(guò)與臨床單位的合作,先后在國際上首次發(fā)現牙齒涎磷蛋白基因突變導致遺傳性乳光牙本質(zhì)(Nature Genetics,2001, 27: 151)、T型鈣離子通道H基因變異與兒童失神癲癇發(fā)病有關(guān)(Annals of Neurology,2003, 54: 239)、鈉離子通道a亞單位SCN9A基因突變導致紅斑肢痛癥(Journal of Medical Genetics,2004; 41: 171)、CRYGS基因突變導致單純先天性白內障(Journal of Medical Genetics,2005; 42: 706)。在復雜疾病易感基因研究方面,通過(guò)提出分析多基因聯(lián)合效應與疾病關(guān)系的新研究策略,與合作伙伴一起,以精神分裂癥為切入點(diǎn),在國際上首次以疾病相關(guān)的整條通路作為研究對象,研究通路上所涉及的基因組合作用與疾病易感性的關(guān)系,這一研究策略和方法得到國際同行的高度評價(jià)(Molecular Psychiatry, 2004, 9: 510)。參加了國際人類(lèi)基因組計劃中中國承擔的1%(3號染色體短臂末端)基因組測序項目,并擔任項目執行組成員,負責國家人類(lèi)基因組北方研究中心承擔任務(wù)的組織領(lǐng)導和計劃實(shí)施。參加痢疾桿菌福氏2A株全基因組序列分析工作。參與鉤端螺旋體基因組DNA測序工作。建立了發(fā)育中期人胎腦海馬基因表達譜,發(fā)現13個(gè)基因可能與出生后海馬學(xué)習記憶功能有聯(lián)系。參加甲型血友病、地中海貧血、脆性X綜合征等遺傳病基因診斷研究。
  已發(fā)表國際SCI收錄論文160余篇、綜述32篇、參加編寫(xiě)專(zhuān)著(zhù)8部。獲《國家自然科學(xué)獎》二等獎2項(第1完成人和第2完成人各1項),《中華醫學(xué)科技獎》一等獎2項(第1完成人和第2完成人各1項)、三等獎1項(第1完成人),《衛生部科技進(jìn)步獎》二等獎1項(第2完成人),《北京市科學(xué)技術(shù)獎》二等獎2項(第1完成人和第2完成人各1項)。2005年獲何梁何利科技進(jìn)步獎。

許琪研究員,協(xié)和學(xué)者特聘教授,中國醫學(xué)科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)中心常務(wù)副主任。女,1975年1月10日出生,1996年畢業(yè)于北京醫科大學(xué)臨床醫學(xué)專(zhuān)業(yè),獲醫學(xué)學(xué)士學(xué)位;同年進(jìn)入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所歷任實(shí)習研究員、助理研究員;2004年于中國協(xié)和醫科大學(xué)畢業(yè),獲生化與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)理學(xué)博士學(xué)位;同年被聘為中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所副研究員;2009年受聘為中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所研究員、博士生導師;2011年受聘為“協(xié)和學(xué)者”特聘教授。2016年獲國家自然科學(xué)基金杰出青年基金。現任中國醫學(xué)科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)中心常務(wù)副主任。
    近10年來(lái)一直從事精神分裂癥等重性精神疾病發(fā)生的分子機制研究,曾作為課題負責人先后承擔863課題1項、973課題3項、863重大項目子課題1項、國家自然科學(xué)基金4項(面上、重點(diǎn)、優(yōu)青、杰青)、北京市自然科學(xué)基金2項。醫科院創(chuàng )新工程重大項目“神經(jīng)科學(xué)與重大神經(jīng)退行性疾病防治研究”首席研究員。現任《Molecular & Cellular Epilepsy》、《World Journal of Psychiatry》、《中華醫學(xué)遺傳學(xué)雜志》、《遺傳》等國內外期刊雜志的編委;中國生化學(xué)會(huì )醫學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)分會(huì )青年委員會(huì )主任、中國遺傳學(xué)會(huì )青年工作委員會(huì )委員、中國生理學(xué)會(huì )應用生理學(xué)分會(huì )委員、北京藥理學(xué)會(huì )神經(jīng)精神藥理專(zhuān)業(yè)委員會(huì )副主任委員、北京醫學(xué)會(huì )醫學(xué)遺傳學(xué)分會(huì )常務(wù)委員。
     現已在Nature(2015)、Journal of Experimental Medicine(2017)、American Journal of Psychiatry(2015)、Nature Structural & Molecular Biology(2011)、Nature Genetics(2011)、Biological Psychiatry (2009,2010)、Molecular Psychiatry(2004)等期刊發(fā)表有關(guān)精神疾病研究的SCI論文60余篇,同時(shí)參加編寫(xiě)專(zhuān)著(zhù)1部,申請精神疾病診斷、藥物開(kāi)發(fā)等相關(guān)國家發(fā)明專(zhuān)利6項。于2005年入選“北京市科技新星計劃”;以其主持的863課題工作為主體的成果分別于2005年和2006年獲中華醫學(xué)科技三等獎和北京市科學(xué)技術(shù)二等獎各1項;2006年獲由國際精神分裂癥研究協(xié)會(huì )頒發(fā)的青年科學(xué)家獎;2008年獲霍英東教育基金會(huì )和教育部評審的第十一屆高等院校青年教師獎;2010年入選“第六批北京市優(yōu)秀青年知識分子”。2015年入選國家“百千萬(wàn)人才工程”(萬(wàn)人計劃),同年被授予“國家有突出貢獻中青年專(zhuān)家”。2016年獲中國青年科技獎。

 

3.課題組成員介紹

    沙龍澤博士,許琪課題組助理研究員。2014年畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué),獲博士學(xué)位,導師許琪教授。主要研究方向為神經(jīng)退行性疾病發(fā)病的分子機制。相關(guān)工作發(fā)表于 J Exp Med (2017),Mol Neurobiol(2016,,2014),Sci. Bull(2018)等學(xué)術(shù)期刊。目前承擔國家自然科學(xué)基金青年基金項目資助(項目號:81501131;2016-2018,24萬(wàn)元),2016年度作為研究骨干參與國家重點(diǎn)研發(fā)計劃《阿爾茨海默病的早期診斷新技術(shù)研發(fā)》,從事阿爾茲海默病的遺傳診斷芯片研發(fā)工作。

    修建波博士,許琪課題組助理研究員。2014年畢業(yè)于中國科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所,獲博士學(xué)位,導師胡海嵐教授。主要研究方向為抑郁癥等情感類(lèi)疾病的發(fā)病機制。開(kāi)發(fā)了TAI-FISH技術(shù)用以研究喜悅和厭惡刺激如何激活腦區不同類(lèi)型的神經(jīng)元。相關(guān)工作發(fā)表于Nat Neurosci(2015)等學(xué)術(shù)期刊。目前承擔國家自然科學(xué)基金面上項目一項。

    韋暉博士,許琪課題組助理研究員。2014年畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué),現就職于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所許琪/沈巖課題組,從事重癥精神疾病發(fā)病機制的研究。主要研究方向有:(1)運用多維度生物標志物建立重癥精神疾病早期預警體系;(2)重癥精神疾病的遺傳學(xué)機制;(3)自身免疫在重癥精神疾病中的致病機制。已發(fā)表論文有:(1)精神分裂癥血漿miRNA生物標志物的篩查(American Journal of Psychiatry.2015);(2)PGD2水平對MDD樣行為的影響(Int J Neuropsychopharmacol.2017)。現承擔國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金一項;青年人才托舉工程一項;參與兩項國家重點(diǎn)研發(fā)計劃,其中一項為子課題負責人。

 

4.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

重性精神疾病發(fā)病機制

國家杰出青年科學(xué)基金

350萬(wàn)元

2017

2021

2

基于家系的重性精神疾病間發(fā)生重疊分子機制研究

國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目

329 萬(wàn)元

2015

2019

3

DTNBP1選擇性剪接異常在精神分裂癥發(fā)病中的作用機制研究

國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金

100 萬(wàn)元

2013

2015

4

星形膠質(zhì)細胞mTOR通路異常激活在內側顳葉癲癇中致病機制的研究

國家自然科學(xué)基金面上項目

80 萬(wàn)元

2015

2018

5

MDD分子遺傳學(xué)與表觀(guān)遺傳學(xué)機制

973子課題

211萬(wàn)元

2013

2017

6

精神分裂癥精準化診斷技術(shù)研究

北京市科技計劃

600萬(wàn)元

2015

2017

7

神經(jīng)科學(xué)與重大神經(jīng)退行性疾病防治研究

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新項目

1510萬(wàn)

2016

2020

 

5.課題組近5年代表性論文

(1) Na Cai#, Tim B. Bigdeli#, Warren Kretzschmar#, Yihan Li#, …., Qi Xu*, Jun Wang*, Kenneth S. Kendler*& Jonathan Flint*. Sparse whole-genome sequencing identifies two loci for major depressive disorder. Nature. 2015 Jul 30;523(7562):588-91. (首次在全基因組范圍報道重度抑郁癥的易感基因,被科學(xué)界和媒體廣泛報道)

(2) Wei H#, Yuan Y#, Liu S, Wang C, Yang F, Lu Z, Wang C, Deng H, Zhao J, Shen Y, Zhang C*, Yu X*, Xu Q*. Detection of circulating miRNA levels in schizophrenia. American Journal of Psychiatry. 2015 Nov 1, 172(11): 1141-1147. (對精神分裂癥患者的長(cháng)期跟蹤隨訪(fǎng),挖掘到兩個(gè)新的miRNA可作為診斷標志物,發(fā)表于精神疾病領(lǐng)域top1的雜志)

(3) Sha L*, Wang X*, Li J, Shi X, Wu L, Shen Y, Xu Q* Pharmacologic inhibition of Hsp90 to prevent GLT-1 degradation as an effective therapy for epilepsy. J Exp Med. 2017 Feb;214(2):547-563. Highlighted by Nature Reviews Drug Discovery

(4) Wang X#, Sha L#, Sun N, Shen Y, Xu Q*. Deletion of mTOR in Reactive Astrocytes Suppresses Chronic Seizures in a Mouse Model of Temporal Lobe Epilepsy.Mol Neurobiol. 2017 Jan;54(1):175-187.

(5) Sha L#, Wu X#, Yao Y, Wen B, Feng J, Sha Z, Wang X, Xing X, Dou W, Jin L, Li W, Wang N, Shen Y, Wang J, Wu L, Xu Q*. Notch signaling activation promotes seizure activity in temporal lobe epilepsy.Mol Neurobiol. 2014 Apr;49(2):633-44.

(6) Shi Y#, Li Z#, Xu Q#, Wang T, Li T, Shen J, Zhang F, Chen J, Zhou G, Ji W, Li B, Xu Y, Liu D, Wang P, Yang P, Liu B, Sun W, Wan C, Qin S, He G, Steinberg S, Cichon S, Werge T, Sigurdsson E, Tosato S, Palotie A, N?then MM, Rietschel M, Ophoff RA, Collier DA, Rujescu D, Clair DS, Stefansson H, Stefansson K, Ji J, Wang Q, Li W, Zheng L, Zhang H, Feng G, He L*. Common variants on 8p12 and 1q24.2 confer risk of schizophrenia. Nature Genetics. 2011 Oct 30;43(12):1224-7. (首次報道中國人群精神分裂癥全基因組范圍的易感基因)

(7) Weirui Guo#, Yanbo Chen#, Xiaohong Zhou#, Amar Kar, Payal Ray, Xiaoping Chen, Elizabeth J Rao, Mengxue Yang, Haihong Ye, Li Zhu, Jianghong Liu, Meng Xu, Yanlian Yang, Chen Wang, David Zhang, Eileen H Bigio, Marsel Mesulam, Yan Shen*, Qi Xu*, Kazuo Fushimi, Jane Y Wu*. An ALS-associated mutation affecting TDP-43 enhances protein aggregation, fibril formation and neurotoxicity. Nature Structural & Molecular Biology. 2011 Jun 12; 18(7):822-30.

(8) Zhang J, Chen Y, Zhang K, Yang H, Sun Y, Fang Y, Shen Y*, Xu Q*. A cis-Phase Interaction Study of Genetic Variants Within the MAOA Gene in Major Depressive Disorder. Biological Psychiatry. 2010 Nov 1;68(9):795-800. 

 

6. 課題組近5年專(zhuān)利

許琪,沙龍澤,沈巖。17-丙烯胺-17-去甲氧格爾德霉素在制備治療癲癇的藥物中的用途。ZL201510146512.3

 

四、蔣澄宇課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

實(shí)驗室自從2003年建立以來(lái),長(cháng)期致力于呼吸系統肺損傷相關(guān)疾病的致病機理的研究和藥物研發(fā)。闡述了SARS冠狀病毒,禽流感H5N1,甲流,和艾博拉等病毒和微納米細顆粒物引發(fā)致病的分子機理。研究成果發(fā)表在《自然》、《自然·醫學(xué)》、《自然·通訊》、和《科學(xué)·信號》等雜志上。曾獲得中, 美, 歐盟等國專(zhuān)利,并曾獨家轉讓給世界排名前五名的制藥公司和歐盟的生物技術(shù)公司。目前課題組有教授1名,副研究員1名,助理研究員1名,高級技師1名,博士后2名,技術(shù)員2名,研究生10余名。

 

2. 課題組負責人介紹

蔣澄宇教授1988年畢業(yè)于中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生物系,獲理學(xué)學(xué)士學(xué)位,1997年畢業(yè)于美國布朗大學(xué)分子生物,細胞生物,和生物化學(xué)系和布朗醫學(xué)院病理與實(shí)驗室醫藥系,獲博士學(xué)位。隨后在美國哈佛醫學(xué)院遺傳系與麻省總醫院分子生物學(xué)系做博士后工作。2003年回國在北京協(xié)和醫學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)系工作。

 

3. 課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

肺損傷相關(guān)疾病整體調節的轉化醫學(xué)研究創(chuàng )新團隊

創(chuàng )新人才推進(jìn)計劃(重點(diǎn)領(lǐng)域創(chuàng )新團隊)

 

2014

2019

2

大氣細顆粒物引發(fā)呼吸道損傷的病理生理學(xué)機制與干預研究

國家重點(diǎn)基礎研究計劃(973計劃)

402

2015

2019

3

病原體感染導致肺氣血屏障損傷的關(guān)鍵機制和干預新靶點(diǎn)

重大項目

339

2015

2019

4

重癥肺炎和急性肺損傷新型診斷標準的建立及臨床防治方案的優(yōu)化

國家衛生和計劃生育委員會(huì )

 

2013

2016

5

血管緊張素轉化酶2H5N1型高致病性禽流感病毒導致急性肺損傷過(guò)程中的作用機制研究

國家自然基金

 

2014

2016

6

非編碼RNA-蛋白質(zhì)功能網(wǎng)絡(luò )在急性肺損傷發(fā)生發(fā)展中的調控機理研究和防護藥物研發(fā)

國家自然基金-重點(diǎn)項目

290

2013

2017

7

急性肺損傷的精確轉化醫學(xué)研究

北京協(xié)和醫學(xué)院

 

2013

2016

8

Metabolic Regulation and Its Roles in Influenza Virus Infection

中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所

 

2014

2015

 

4. 課題組近5年代表性論文

(1) Du, J., Liang, Z., Xu, J., Zhao, Y., Li, X., Zhang, Y., ...& Jiang, C. (2017). Plant-derived phosphocholine facilitates cellular uptake of anti-pulmonary fibrotic HJT-sRNA-m7. Science China Life Sciences, 1-12.

(2) Zhang, Y.L., Tang, J., Yang, N., Liu, Q., Zhang, Q.C., Zhang, Y.X., Li, N., Zhao, Y., Li, S.W., Liu, S., Zhou, H.D., Li, X., Tian, M.Y., Deng, J.J., Xie, P., Sun, Y., Lu, H.J., Zhang, M.Q., Jin, N.Y., Jiang, C., FAT10 Is Critical in Influenza A Virus Replication by Inhibiting Type I IFN, Journal of Immunology, 2016

(3) Ju X., Yan Y., Liu Q., Li N., Sheng M., Zhang L., Li X., Liang Z., Huang F., Liu K., Zhao Y., Zhang Y., Zou Z., Du J., Zhong Y., Zhou H., Yang P., Lu H., Tian M., Li D., Zhang J., Jin N., Jiang C. Neuraminidase of influenza A virus binds lysosome-associated membrane proteins directly and induces lysosome rupture, Journal of Virology, 2015

(4) Zou, Z, Yan, Y, Shu, Y, Gao, R, Sun, Y, Li, X, Ju, X, Liang, Z, Liu, Q, Zhao, Y, Guo, F, Bai, T, Han, Z, Zhu, J, Zhou, H, Huang, F, Li, C, Lu, H, Li, N, Li, D, Jin, N, Penninger*, JM, Jiang*, C (2014) Angiotensin-Converting Enzyme 2 protects from lethal Avian Influenca A H5N1 Infections Nat Commun 10.1038/ncomms4594.

(5) Huang, F, Guo, J, Zou, Z, Liu, J, Cao, B, Zhang, S, Li, H, Wang, W, Sheng, M, Liu, S, Pan, J, Bao, C, Zeng, M, Xiao, H, Qian, G, Hu, X, Chen, Y, Chen, Y, Zhao, Y, Liu, Q, Zhou, H, Zhu, J, Gao, H, Yang, S, Liu X, Zheng, S, Yang, J, Diao, H, Cao, H, Wu, Y, Zhao, M, Tan, S, Guo, D, Zhao, X, Ye,Y, Wu, W, Xu, Y, Penninger, JM, Li, D, Gao*, G, Jiang*, C, Li*, L (2014) Angiotensin II plasma levels are linked to disease severity and predict fatal outcomes in H7N9-infected patients. Nat Commun 10.1038/ncomms4595

(6) Xu*, C, Ju, X, Song, D, Huang, F, Tang D, Zou, Z, Zhang, C, Joshi, T, Jia, L, Xu, W, Xu, K, Wang, Q, Xiong, Y, Guo, Z, Chen, X, Huang, F, Xu, J, Zhong, Y, Zhu, Y, Peg, Y, Wang, L, Zhang, X, Jiang, R, Li, D, Jiang, T, Xu, D, Jiang*, C (2014) An association analysis between psychophysical characteristics and genome-wide gene expression changes in human adaption to the extreme climate at the Antarctic Dome Argus Mol Psychiatry 10.1038/mp.2014.72.

(7) Sheng, M, Zhong, Y, Chen, Y, Du, J, Ju, X, Zhao, C, Zhang, G, Zhang, L, Liu, K, Yang, N, Xie, P, Li, D, Zhang*, M.Q, Jiang*, C (2014) Hsa-miR-1246, hsa-miR-320a and hsa-miR-196b-5p inhibitors can reduce the cytotoxicity of Ebola virus glycoprotein in vitroSci China Life Sci. 57(10):959-72

(8) Wang, W, Yang, P, Zhong, Y, Zhao, Z, Xing, L, Zhao, Y, Zou, Z, Zhang, Y, Li, C, Li, T, Wang, C, Wang, Z, Yu, X, Cao, B, Gao, X, Penninger, J, Wang*, X, Jiang*, C (2013) Monoclonal Antibody Against CXCL-10/ IP-10 Ameliorated Influenza A (H1N1) Induced Acute Lung Injury. Cell Res. 23:577-580

(9) Yan, Y, Zou, Z, Sun, Y, Li, X, Xu, K, Wei, Y, Jin*, N, Jiang*, C (2013) Anti-Malaria Drug Chloroquine is Highly Effective in Treating Avian Influenza A H5N1 Virus Infection in an Animal Model Cell Res. 23:300-302

(10) Zhang, Y, Deng, J, Zhang, Y, Guo, F, Li, C, Zou, Z, Xi, W, Tang, J, Sun, Y, Yang, P, Han, Z, Jiang*, C (2013) Functionalized Single-Walled Carbon Nanotubes Cause Reversible Acute Lung Injury and Induce Fibrosis in Mice J. Mol. Med. 91:117-128

(11) Sun, Y, Li, C, Shu, Y, Wang, H, Ju, X, Zou, ZWang, H, Rao, S, Guo, F, Liu, H, Nan, W, Zhao, Y, Yan, Y, Tang, J, Zhao, C, Yang, P, Liu, K, Wang, S, Lu, H, Li, X, Tan, L, Gao, R, Song, J, Gao, X, Tan, X, Qin, Y, Xu, K, Li D, Jin*, N, Jiang*, C (2012) Inhibition of Autophagy Ameliorates Acute Lung Injury Caused by Avian Influenza A H5N1 Infection. Science Signaling (Cover Story) 5 (212) ra16

(12) Yang, N, Ma, P, Lang, J, Zhang, Y, Deng, J, Ju, X, Zhang, G, Jiang*, C (2012) Phosphatidylinositol 4-Kinase III_ Is Required for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Spike-mediated Cell Entry. J. Biol. Chem. 287(11) 8457-8467

(13) Li, C, Yang, P, Sun, Y, Li, T, Wang, C, Wang, Z, Zou, Z, Yan, Y, Wang, W, Wang, C, Chen, Z, Xing, L, Tang, C, Ju, X, Guo, F, Deng, J, Zhao, Y, Yang, P, Tang, J, Wang, H, Zhao, Z, Yin, Z, Cao, B, Wang*, X, Jiang*, C (2012) IL-17 response mediates acute lung injury induced by the 2009 Pandemic Influenza A (H1N1) Virus. Cell Res. 22:528-538

 

5. 課題組近5年專(zhuān)利

(1)SSU72蛋白的應用(MP1613950)

(2)中藥提取物在制備核酸遞送試劑中的應用及其相關(guān)產(chǎn)品(PCT/CN2017/078683)

(3)小RNA及其用于預防和/或治療纖維增生性病癥和/或綜合(PCT/CN2017/078815)

(4)CXCL-10抑制劑在制備和/或預防肺損傷的藥物中的用途(201210150909.6)


五、李雋課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

本課題組建立于2018年,承擔項目包括中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程。實(shí)驗室主要從事衰老的分子機制和抗衰老干預方法的研究和應用。現有工作人員包括:李雋(研究員)、張曉倩助理研究員、李嘉技術(shù)員)、王思齊技術(shù)員),在讀博士研究生2人,碩士研究生5人。課題組現階段以主要研究方向包括:1)細胞衰老的發(fā)生機制及調控;2)NAD代謝對衰老進(jìn)程的調控;3)DNA損傷/修復對細胞及機體水平衰老的影響和調控。課題組結構年輕朝氣蓬勃,學(xué)術(shù)氣氛積極融洽勇于探索。歡迎各位有志于衰老和抗衰老科學(xué)研究的考生報考。

 

2. 課題組負責人介紹

李雋研究員,女,博士生導師,本科畢業(yè)于北京大學(xué)醫學(xué)部基礎醫學(xué)專(zhuān)業(yè),2010年在美國Texas A&M University 獲得生物化學(xué)與生物物理博士學(xué)位。博士后研究師從于哈佛醫學(xué)院遺傳系David Sinclair教授進(jìn)行衰老的分子機制和抗衰老介入研究。2018年8月受聘于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所/北京協(xié)和醫學(xué)院基礎醫學(xué)院,擔任生物化學(xué)與分子生物學(xué)系課題組長(cháng),醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室研究員。2018年入選中國醫學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫學(xué)院 “高端科技人才”引進(jìn)專(zhuān)項支持計劃“優(yōu)秀青年人才”。曾在Science,Cell Metabolism,Nature Communications,Biochemistry, Cell cycle等多個(gè)雜志發(fā)表過(guò)原創(chuàng )性研究成果,并長(cháng)期擔任Apoptosis, Molecular Cellular Biology, JBC等雜志審稿人。

 

3. 課題組成員介紹

張曉倩助理研究員女,1986年12月出生,博士。2016年7月畢業(yè)于中國科學(xué)院生物物理研究所,理學(xué)博士。2016-2019年于中國科學(xué)院動(dòng)物研究從事博士后研究。20201月加入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系。作為第一作者或共一作者Stem Cell ResearchProtein & Cell等國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文2篇。目前研究方向為衰老及衰老相關(guān)疾病的調控網(wǎng)絡(luò )及致病機理為調控干預衰老提供理論基礎和潛在靶點(diǎn)

 

5.代表性論文

(1) Evandro F. Fang, Chenglong Xie, Joseph A. Schenkel, Chenkai Wu, Qian Long, Honghua Cui, Yahyah Aman, Johannes Frank, Jing Liao, Huachun Zou, Ninie Y. Wang, Jing Wu, Xiaoting Liu, Tao Li, Yuan Fang, Zhangming Niu, Guang Yang, Jiangshui Hong, Qian Wang, Guobing Chen, Jun Li, Hou-Zao Chen, Lin Kang, Huanxing Su, Brian C. Gilmour, Xinqiang Zhu, Hong Jiang, Na He, Jun Tao, Sean Xiao Leng, Tanjun Tong, Jean Woo. A research agenda for ageing in China in the 21st century (2nd edition): Focusing on basic and translational research, long-term care, policy and social networks, Ageing Research Reviews, 2020;101174,

(2) Bolderson E, Burgess JT, Li J, et al. Barrier-to-autointegration factor 1 (Banf1) regulates poly [ADP-ribose] polymerase 1 (PARP1) activity following oxidative DNA damage. Nature Communication. 2019;10(1):5501.

(3) Jun Li, Michael S. Bonkowski, Sébastien Moniot, Dapeng Zhang, Basil P. Hubbard, Alvin J.Y. Ling, Luis A. Rajman, Bo Qin, Zhenkun Lou, Vera Gorbunova, L. Aravind, Clemens Steegborn and David A. Sinclair. A conserved NAD+ binding pocket that regulates protein-protein interactions during aging. Science, 2017, 355(6331): 1312-1317.

(4) Evandro Fei Fang, Henok Kassahun, Deborah L. Croteau, Morten Scheibye-Knudsen, Huiming Lu, Raghavendra A. Shamanna, Sumana Kalyanasundaram, Ravi Chand Bollineni, Mark A. Wilson, Wendy B. Iser, Bradley N. Wollman, Marya Morevati, Jun Li, Jesse S. Kerr, Qiping Lu, Tyler B. Waltz, Jane Tian, David A. Sinclair, Mark P. Mattson, Hilde Nilsen, Vilhelm A. Bohr. NAD+ replenishment significantly improves outcomes in Ataxia telangiectasia models via mitophagy and DNA repair, Cell Metabolism, 2016, 24(4): 566-581.

(5) Hubbard BP, Loh C, Gomes AP, Li J, Lu Q, Doyle TL, Disch JS, Armour SM, Ellis JL, Vlasuk GP, Sinclair DA. Carboxamide SIRT1 inhibitors block DBC1 binding via an acetylation-independent mechanism, Cell cycle. 2013,12(14): 2233-2240.

(6) Hubbard, P., Gomes, A., Dai, H., Li, J., Case, A., Considine, T., Riera, T., Lee, J., Yen, ES, Lamming, D., Pentelute, B., Schuman, E., Stevens, L., Ling, A., Armour, S., Michan, S., Zhao, H., Jiang, Y., Sweitzer, S., Blum, C., Disch, J., Ng, PY., Howitz, K., Hamaro, Y., Moss, J., Perni, R., Ellis, J., Vlasuk, G. and Sinclair, D.A. Evidence for a common mechanism of Sirt1 activation by small molecules. Science, 2013, 339(6124): 1216-1219.

(7) Jun Li and Paul Fitzpatrick. Regulation of Phenylalanine Hydroxylase: Conformational changes upon phosphorylation detected by H/D exchange and mass spectrometry, Arch Biochem Biophys. 2013, 535(2): 115-119.

(8) Jun Li, Udayar Ilangovan, Susan Daubner, Andy Hinck, Paul Fitzpatrick. Direct evidence for a phenylalanine site in the regulatory domain of phenylalanine hydroxylase. Arch Biochem Biophys. 2011, 505(2): 250-255.

(9) Jun Li, Larry Dangott, and Paul Fitzpatrick. Regulation of Phenylalanine Hydroxylase: Conformational changes upon phenylalanine binding detected by H/D exchange and mass spectrometry. Biochemistry. 2010, 49(15): 3327-3335.

(10) Jun Li and Paul Fitzpatrick. Characterization of metal ligand mutants of phenylalanine hydroxylase: Insights into the plasticity of a 2-histidine-1-carboxylate triad. Arch Biochem Biophys. 2008, 475: 164-168.

(11) Shu-yan Li, Zeng-Gang Li, Jun Li, Ju-hua Ni, and Hong Ti Jia. Expression and Editing Status of Glutamate Receptor GluR2 Subunit in Audiogenic Seizure-Susceptible P77PMC Rats. Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology. 2005, 21 (1): 78-83.

 

六、劉英課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

曾主持國家自然科學(xué)基金項目、國家科技攻關(guān)、國家重點(diǎn)基礎研究發(fā)展計劃(973)子課題、國家科技重大專(zhuān)項等研究項目。以通訊作者在Hepatology、Molecular Therapy、Human Molecular Genetics、Journal Medical Genetics等國際專(zhuān)業(yè)雜志發(fā)表研究論文40余篇,其中一篇論文2012年獲得中國百篇最具影響國際學(xué)術(shù)論文稱(chēng)號。課題組現有副主任技師1人、副研究員1人,在讀博士生2人、碩士生3人。已培養畢業(yè)博士生13人、碩士生22人。

 

2. 研究方向

(1). 慢性乙型肝炎和肝細胞肝癌發(fā)生發(fā)展的分子機制研究 尋找、鑒定與慢性乙型肝炎和肝細胞肝癌發(fā)生發(fā)展以及藥物療效相關(guān)的基因及遺傳多態(tài)性位點(diǎn),并在此基礎上開(kāi)展基因/蛋白的功能研究,以闡明疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制,為疾病治療提供信號通路潛在新靶點(diǎn)和新策略。

(2). 神經(jīng)系統單基因遺傳性疾病致病基因的鑒識及其功能研究 通過(guò)基因突變篩查策略,鑒識神經(jīng)系統單基因遺傳性疾病的致病基因,并研究致病基因突變體導致突觸功能異常的分子機制,為疾病的診斷和治療提供科學(xué)依據。


3. 課題組負責人介紹

劉英,女,研究員,博士生導師。1999年3月畢業(yè)于日本國鳥(niǎo)取大學(xué)生命科學(xué)系生物化學(xué)專(zhuān)業(yè),獲得博士學(xué)位;自1999年5月至今在中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所 北京協(xié)和醫學(xué)院基礎學(xué)院 生物化學(xué)與分子生物學(xué)系 醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室工作,現任北京生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì )監事長(cháng)、《中華醫學(xué)遺傳學(xué)雜志》編委,2015年榮獲第七屆“國家衛生計生有突出貢獻中青年專(zhuān)家”稱(chēng)號。

 

4. 課題組人員

姓名

性別

職稱(chēng)

聯(lián)系方式

1

 

研究員

liuyingpumc@163.com

2

朱席琳

副主任技師

xlxl7280@163.com

3

伍曉盼

副研究員

wuxiaopanpumc@163.com

4

楊曉爽

博士研究生

 

5

張俊媛

博士研究生

 

6

汪媛媛

碩士研究生

 

7

鄭媛戈

碩士研究生

 

8

盧莉莉

碩士研究生


5. 承擔科研項目

(1). 國家重點(diǎn)研發(fā)計劃,輔助生殖/自然妊娠隊列核心家系的全基因組圖譜構建及基因組特征變異的系統鑒定,項目編號2021YFC2700601,起止時(shí)間:2021年-2024年,參加。

(2). 中國醫學(xué)科學(xué)院創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新項目,疾病的物質(zhì)能量代謝轉化機制和干預的基礎研究,項目編號2021-I2M-1-016,起止時(shí)間:2021年-2025年,參加。

 

6. 以通訊作者發(fā)表的代表性論文

(1). ADAR1 Stimulation by IFN-a Downregulates the Expression of MAVS via RNA Editing to Regulate the Anti-HBV Response. Molecular Therapy, 2021;29(3):1335-1348. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2020.11.031

(2). PRRT2 deficiency induces paroxysmal kinesigenic dyskinesia by influencing synaptic function in the primary motor cortex of rats. Neurobiology of Disease, 2019; 121:274–285. https://doi.org/10.1016/j.nbd.2018.10.011

(3). Genetic Variation in STAT4 Predicts Response to Interferon-a Therapy for Hepatitis B e Antigen-Positive Chronic Hepatitis B. HEPATOLOGY, 2016;63( 4):1102-1111. https://doi.org/10.1002/hep.28423

(4). A genome-wide association study identifies polymorphisms in the HLA-DR region associated with non-response to hepatitis B vaccination in Chinese Han populations. Human Molecular Genetics, 2014;23(8):2210-2219. https://doi:10.1093/hmg/ddt586

(5). A missense polymorphism in ATF6 gene is associated with susceptibility to hepatocellular carcinoma probably by altering ATF6 level. Int J Cancer, 2014; 135:61–68. https://doi:10.1002/ijc.28649

(6). Polymorphisms in the VEGFA promoter are associated with susceptibility to hepatocellular carcinoma by altering promoter activity. Int J Cancer, 2013;133(5):1085-1093. https://doi:10.1002/ijc.28109

(7). Targeted genomic sequencing identifies PRRT2 mutations as a cause of paroxysmal kinesigenic choreoathetosis. J Med Genet, 2012;49:76-78. https://doi: 10.1136/jmedgenet-2011-100635

(8). Polymorphisms in ADAR1 gene affect response to interferon alpha based therapy for chronic hepatitis B in Han Chinese. Antiviral Research, 2012;94:272–275. http://doi.10.1016/j.antiviral.2012.03.004

(9). Evaluation of susceptibility locus for response to interferon-α based therapy in chronic hepatitis B patients in Chinese. Antiviral Research, 2012;93:297-300. http://doi:10.1016/j.antiviral.2011.12.009

 

7. 承擔教學(xué)任務(wù)

現承擔中國醫學(xué)科學(xué)院 北京協(xié)和醫學(xué)院研究生《重大疾病研究進(jìn)展》學(xué)位課程部分授課工作。

 

七、余佳課題組

1. 課題組簡(jiǎn)介

本課題組由張俊武研究員建立于1993年,承擔過(guò)國家七五、863、基礎研究重大前期專(zhuān)項、973、重大科學(xué)計劃、美國中華醫學(xué)基金(CMB)、國家自然科學(xué)基金重大項目和面上項目等,過(guò)去近二十年重點(diǎn)研究珠蛋白基因表達調控、造血相關(guān)基因功能及機制老年性癡呆(AD)相關(guān)基因已畢業(yè)博士33人,碩士6人。共發(fā)表論文130多篇(SCI 44篇)。2012年,余佳研究員接任課題組長(cháng),現有工作人員包括:余佳(研究員)、 張俊武(研究員)、馬艷妮(副研究員)、王小爽助理研究員趙華路(副主任技師)、司艷敏(技術(shù)員)、郭江濤技術(shù)員、何金蓉技術(shù)員)及博士后1人,在讀博士研究生8人,碩士研究生2人,聯(lián)合培養博士后1人。課題組現階段以RNA和干細胞生物學(xué)為主要研究方向,建立了完善的胚胎干細胞造血干細胞研究體系RNA實(shí)驗體系及計算生物學(xué)平臺并與國內多個(gè)領(lǐng)域內一流實(shí)驗室建立了緊密合作關(guān)系共享研究資源、共同培養研究生與博士后。課題組既有豐富的歷史沉淀,又年輕而朝氣蓬勃,學(xué)術(shù)氣氛積極向上,致力于成為“嚴謹、求實(shí)、快樂(lè )、奮進(jìn)”的研究團隊。歡迎各位有志于科學(xué)研究、對干細胞及RNA生物學(xué)感興趣的考生報考。

 

2. 課題組負責人介紹

余佳研究員,男,1978年生,博士生導師,RNA與干細胞生物學(xué)研究組組長(cháng),醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室PI,國家杰出青年科學(xué)基金獲得者。2006年7月畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系,理學(xué)博士。2006-2007年在美國伊利諾伊大學(xué)芝加哥分校工作(Post-doc)。2007-2009年在美國西北大學(xué)Feinberg醫學(xué)院工作(Post-doc),師從毛囊干細胞發(fā)現者之一Robert Lavker教授。2009年10月作為人才引進(jìn)加入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化系,醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室工作。2012年4月聘任為研究組長(cháng),醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室PI。作為負責人承擔國家自然科學(xué)基金委重大研究計劃、重點(diǎn)項目及面上項目等;作為負責人承擔科技部973子課題、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃及國家重大研究計劃。獲“國家杰出青年科學(xué)基金”(2017,生命科學(xué)部)、北京市“科技新星”(2011)、“協(xié)和新星”(2010)、人事部“回國留學(xué)人員擇優(yōu)資助” (2010)等人才計劃支持余佳博士同時(shí)擔任中國醫學(xué)科學(xué)院-以色列Weizmann研究所聯(lián)合實(shí)驗室PI,中國醫學(xué)科學(xué)院“醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程”創(chuàng )新團隊項目首席科學(xué)家,人血細胞分子圖譜(ABC)研究聯(lián)盟首批倡議及參加成員。近五年作為通訊作者在Nature Communications、The EMBO Journal、Cell Research、Cancer Research、Nucleic Acids Research、Autophagy、OncogeneMCB等國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文20余篇,被引用1900余次。目前擔任北京市生化協(xié)會(huì )理事、青年委員會(huì )主任;中國生理學(xué)會(huì )血液生理專(zhuān)業(yè)委員會(huì )青年委員;中國病理生理學(xué)會(huì )實(shí)驗血液學(xué)分會(huì )青年委員;中國研究型醫院協(xié)會(huì )血液病精準診療專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員,擔任Blood, Nucleic Acids Research, Oncogene, Cancer Research, MCB, JBC等雜志特邀審稿人。

 

3. 課題組成員介紹

張俊武研究員男,1946年9月出生。1970年北京大學(xué)生化專(zhuān)業(yè)本科畢業(yè)后留校作助教。1979年入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所做研究生,1982年獲碩士學(xué)位后留所。1985-88及1991-92在美國Univ. of Washington醫學(xué)遺傳專(zhuān)業(yè)和Markey分子醫學(xué)中心做senior fellow。1993年為醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室研究員,1994年獲博導資格。研究過(guò)地中海貧血等遺傳病基因診斷、老年性癡呆相關(guān)基因、低氧應答機制和珠蛋白基因表達調控。近幾年重點(diǎn)研究與髓系細胞分化和急性髓系白血病相關(guān)的蛋白質(zhì)基因和非編碼RNA的功能機制及表達調控。共發(fā)表論文160余篇(SCI 77篇,SCI引用千余次)。曾獲3項國家科技進(jìn)步獎(二等1項,三等2項,第2或3完成人)及8項部級成果獎(一等1項,二等7項,5項為第1或2完成人)。主編論著(zhù)1部血紅蛋白與血紅蛋白病,參編10部。多年作為研究生《基因分子生物學(xué)》和《醫學(xué)分子生物學(xué)》課程主講之一。1998年被評為國家突出貢獻中青年專(zhuān)家,2001年獲政府特殊津貼。

馬艷妮副研究員女,1981年11月出生,副研究員,碩士生導師。2008年7月畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系,理學(xué)博士。2008-2011年于中國科學(xué)院生物物理研究所任助理研究員。2011年7月加入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系,醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室工作。作為負責人承擔國家自然科學(xué)基金委青年基金項目、面上項目,作為科研骨干參與科技部973項目,國家重點(diǎn)研發(fā)計劃。北京市“科技新星”(2017)、“協(xié)和新星”(2015)等人才計劃支持作為第一作者或通訊作者在EMBO J、Mol Cell Bio、Sci Rep等國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文8篇。以共作者在Cell Res、Oncogene、NAR、Cancer Res、Cell Death&Differ等國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文17篇。目前研究方向為非編碼RNA及RNA結合蛋白在多能干細胞分化、紅細胞發(fā)育成熟、珠蛋白基因表達調控中的功能機制研究。

王小爽助理研究員女,1985年10月出生,博士。2011年7月畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系,理學(xué)博士。2011-2016年于中國科學(xué)院微生物研究所任助理研究員。2016年9月加入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化與分子生物學(xué)系,醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室工作。作為負責人承擔國家自然科學(xué)基金委青年基金項目。作為第一作者或共作者在Blood、Nature Communications、Proc Natl Acad Sci USA、J Infect Dis等國際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表SCI論文10篇。目前研究方向為非編碼RNA及RNA結合蛋白在髓系分化及白血病調控中的功能機制,以及非編碼RNA加工與成熟的分子機制及其在干細胞分化與相關(guān)疾病中的功能機理

 

4. 課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

造血細胞分化調控

 

30

2018

2020

2

造血細胞發(fā)育調控

國家杰出青年科學(xué)基金

350

2018

2022

3

造血干細胞異質(zhì)性的表觀(guān)遺傳調控機理

醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程

200

2017

2020

4

長(cháng)非編碼RNA在造血髓系分化發(fā)育中的功能和機制

重點(diǎn)項目

273

2016

2020

5

精子發(fā)生中LncRNA及互作復合體表達的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò )

國家重大科學(xué)研究計劃

239

2015

2019

6

中胚層主導性miRNA基因簇的鑒定及其“表型彈性”的分子機制探索

重大研究計劃培育項目

80

2015

2017

7

幽門(mén)螺桿菌所致胃組織炎癥惡性轉化過(guò)程中“節點(diǎn)miRNA”分子的鑒定、分子機制及表達調控研究

重大研究計劃培育項目

70

2012

2014

8

Linc-CEBPGKSRP的相互作用對單核細胞分化的調控作用及機理研究

面上項目

80

2014

2017

9

造血干細胞發(fā)育、維持與再生的調控機制

國家重點(diǎn)研發(fā)計劃

200

2016

2020

10

非編碼RNA在干細胞命運與調控中的功能與分子機制

973前期導向項目

150

2011

2015

 

5. 課題組近5年代表性論文

(1) Hongmei Zhao?, Xiaoshuang Wang?, Ping Yi?, Yanmin Si, Puwen Tan, Jinrong He , Shan Yu, Yue Ren, Yanni Ma, Junwu Zhang, Dong Wang*, Fang Wang*, Jia Yu*. KSRP specifies monocytic and granulocytic differentiation through regulating miR-129 biogenesis and RUNX1 expression. Nature Communications. 2017. In press.

(2) Fang Wang?, Wei Song?, Hongmei Zhao?, Yanni Ma, Yuxia Li, Di Zhai, JingnanPi, Yanmin Si, Jiayue Xu, Lei Dong, Rui Su, Mengmeng Zhang, Yong Zhu, Xiaoxia Ren, Fei Miao, Wenjie Liu, Feng Li, Junwu Zhang, Aibin He, Ge Shan,Jingyi Hui, Linfang Wang, Jia Yu*. The RNA-binding protein QKI5 regulates primary miR-124-1 processing via a distal RNA motif during erythropoiesis. Cell Research. 2017 Mar; 27(3):416-439.

(3) Yongfei Hu, Yan Huang, Ying Yi, Hongwei Wang, Bing Liu*, Jia Yu*, Dong Wang*. Single-cell RNA sequencing highlights transcription activity of autophagy-related genes during hematopoietic stem cell formation in mouse embryos. Autophagy. 2017 Apr 3;13(4):770-771.

(4) Ying Yi, Yue Zhao, Chunhua Li, Lin Zhang, Huiying Huang, Yana Li, LanlanLiu, Ping Hou, Tianyu Cui, Puwen Tan, Yongfei Hu, Ting Zhang, Yan Huang,Xiaobo Li*, Jia Yu*, Dong Wang*. RAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms. Nucleic Acids Research. 2017 Jan 4;45(D1):D115-D118.

(5) S Ai, Y Peng, C Li, F Gu, X Yu, Y Yue, Q Ma, J Chen, Z Lin, P Zhou, H Xie, TW Prendiville, W Zheng, Y Liu, SH Orkin, DZ Wang, J Yu, WT Pu, A He. EED orchestration of heart maturation through interaction with HDACs is H3K27me3-independent. Elife. 2017;6.

(6) Rui Su?, Lei Dong?, Dongling Zou, Hongmei Zhao, Yue Ren, Feng Li, Ping Yi, Lanfang Li, Yong Zhu, Yanni Ma, Jing Wang, Fang Wang*, Jia Yu*. microRNA-23a, -27a and -24 synergistically regulate JAK1/Stat3 cascade and serve as novel therapeutic targets in human acute erythroid leukemia. Oncogene. 2016 Nov 17;35 (46):6001-6014. 

(7) Weibin Wang?, Lijun Zhao?, Xueju Wei, Lanlan Wang, Siqi Liu, Yu Yang, Fang Wang, Guotao Sun, Junwu Zhang, Yanni Ma*, Yupei Zhao*, Jia Yu*. MicroRNA-320a promotes 5-FU resistance in human pancreatic cancer cells. Scientific Reports. 2016 Jun 9;6:27641.

(8) Feng Li, Ping Yi, Jingnan Pi, Lanfang Li, Fang Wang*, Aihua Liang*, Jia Yu*.QKI5-mediated alternative splicing of the histone variant macroH2A1 regulates gastric carcinogenesis. Oncotarget. 2016 May 31;7(22):32821-34.

(9) Haixin Yin?, Peng Song?, Rui Su, Guihua Yang, Lei Dong, Min Luo, Bin Wang, Bei Gong, Changzheng Liu, Wei Song, Fang Wang, Yan-Ni Ma, Jun-Wu Zhang, Weibin Wang*, Jia Yu*. DNA Methylation mediated down-regulating ofMicroRNA-33b and its role in gastric cancer. Scientific Reports. 2016 Jan 5;6:18824.

(10) Yanni Ma?, Nan Yao?, Guang Liu?, Lei Dong, Fang Wang, Bin Wang, He Dong,Xueju Wei, Meili Zhang, Shaowei Ji, Yufang Liu, Junwu Zhang, Yangming Wang, Yue Huang*, Jia Yu*. Functional screen reveals essential roles of miR-27a/24 in differentiation of embryonic stem cell. The EMBO Journal. 2015. 34(3):361–378.

(11) Yuxuan Wang?, Changzheng Liu?, Min Luo?, Zhengyi Zhang?, Jianan Gong, Jingjing Li, Lei Dong, Haishuang Lin, Yanni Ma, Fang Wang, Yi Wang, Jie Chen, Junwu Zhang, Hongyan Jia, Yan Kong, Jia Yu*. Chemotherapeutic drugs induced miR-29s-cateninδ signaling suppresses metastasis in gastric cancer. Cancer Research. 2015 April 1. 75(7):1332-44.

(12) W Song, W-J Liu, H Zhao, S-Z Li, X Guan, J-M Ying, Y-F Zhang, X-X Ren,Fei Miao, M-M Zhang, X-L Li, F Wu, Y-C Zhao, Y-Y Tian, W-M Wu, J Fu, J-B Liang, W Wu, C-Z Liu, J Yu, S-D Zong, S-Y Miao, X-D Zhang, L-F Wang. Rhomboid domain containing 1 promotes colorectal cancer growth through activation of the EGFR signaling pathway. Nature Communications. 2015 Aug 24;6:8022.

(13) W-Z Peng, S Si, Q Zhang, C Li, F Zhao, F Wang, J Yu*, R Ma*. Long non-coding RNA MEG3 functions as a competing endogenous RNA to regulate gastric cancer progression. Journal of  Experimental and Clinical CancerResearch. 2015 Aug 8;34:79.

(14) Z Li, H Lei, M Luo, Y Wang, L Dong, Y Ma, C Liu, W Song, F Wang, J Zhang, J Shen*, J Yu*. DNA methylation downregulated mir-10b acts as a tumor suppressor in gastric cancer. Gastric Cancer. 2015 Jan;18(1):43-54. (Cited by 119)

(15) J Gong?, J Li?, Y Wang?, C Liu?, H Jia, C Jiang, Y Wang, M Luo, H Zhao, L Dong, W Song, F Wang, W Wang, J Zhang*, J Yu*. Characterization of miR-29 family expression and investigation of their mechanistic roles in gastric cancer. Carcinogenesis. 2014. 35 (2):497-506. (Cited by 37)

(16) F Wang?, Y Zhu?, L Guo?, L Dong, H Liu, H Yin, Z Zhang, Y Li, C Liu,Y Ma, W Song, A He, Q Wang, L Wang, J Zhang, J Li, J Yu*. A regulatory circuit comprising GATA1/2 switch and microRNA-27a/24 promotes erythropoiesis. Nucleic Acids Research. 2014 Jan;42(1):442-457.

(17) J-N Gong?, J Yu?, H-S Lin?, X-H Zhang, X-L Yin, Z Xiao, F Wang, X-S Wang, R Su, C Shen, H-L Zhao, Y-N Ma and J-W Zhang. The role, mechanism and potentially therapeutic application of microRNA-29 family in acute myeloid leukemia. Cell Death & Differentiation. (2014) 21, 100-112.

(18) Y Ma, B Wang, F Jiang, D Wang, H Liu, Y Yan, H Dong, F Wang, B Gong, Y Zhu, L Dong, H Yin, Z Zhang, H Zhao, Z Wu, J Zhang, J Zhou, J Yu*. A Feedback Loop Consisting of MicroRNA 23a/27a and the β-Like Globin Suppressors KLF3 and SP1 Regulates Globin Gene Expression. Molecular and Cellular Biology. 2013 Oct; 33(20):3994-4007.

(19) Y Zhu?, D Wang?, F Wang?, T Li, L Dong, H Liu, Y Ma, F Jiang, H Yin, W Yan, M Luo, Z Tang, G Zhang, Q Wang, J Zhang, J Zhou, J Yu*. A comprehensive analysis of GATA-1-regulated miRNAs reveals miR-23a to be a positive modulator of erythropoiesis. Nucleic Acids Research. 2013. Apr; 41(7):4129-43.

(20) Jia Yu*, Fang Wang. Recent progress in microRNA study: Benefits from technique advance. SCIENCE CHINA Life Sciences. July 2012. 55 (7): 649-650. Invited comment.

(21) X Wang?, J Gong?, J Yu, F Wang, X Zhang, X Yin, Z Tan, Z Luo, G Yang, C Shen, J Zhang. MicroRNA-29a and microRNA-142-3p are regulators of myeloid differentiation and acute myeloid leukemia. Blood. 2012 May 24;119(21):4992-5004. (Cited by 90)

 

八、石磊課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

本實(shí)驗室1978年由潘華珍教授創(chuàng )建,主要研究膜脂膜蛋白相互作用分子機理及紅細胞膜異常的血液病分子機理研究。1993年許彩民教授接課題組后繼續此方向的研究,同時(shí)開(kāi)始進(jìn)行腫瘤細胞凋亡與信號轉導及基因表達與調控方面的研究,取得了良好的研究進(jìn)展,發(fā)表了一系列的SCI學(xué)術(shù)研究論文。2014年石磊教授接任課題組長(cháng),繼續開(kāi)展膜蛋白和生物膜相關(guān)研究,目前實(shí)驗室以囊膜病毒為研究對象,研究病毒侵染真核細胞過(guò)程中病毒和宿主細胞的膜蛋白、膜結合蛋白在病毒復制過(guò)程中的功能和分子機制。

 

2.課題組負責人介紹

石磊研究員,中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所&北京協(xié)和醫學(xué)院“協(xié)和學(xué)者”特聘教授,博士生導師。2001年畢業(yè)于武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,獲學(xué)士學(xué)位,2006年畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué)基礎醫學(xué)研究所生化及分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè),獲博士學(xué)位。2007-2012年在耶魯大學(xué)、紐約大學(xué)進(jìn)行博士后研究,2014回國加入本所工作,獲國自然基金委“優(yōu)青”基金支持,并獲2015年度“求是杰出青年學(xué)者獎”。擔任中國生物物理學(xué)會(huì )生物膜生物學(xué)專(zhuān)業(yè)分會(huì )理事。近年來(lái)一直從事膜蛋白的功能、機制以及生物膜的相關(guān)研究工作。

 

3.課題組成員介紹

許彩民研究員,博士生導師。畢業(yè)于北京大學(xué)化學(xué)系。1974年以來(lái)一直在中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所工作(其中,1987-1990年在美國北加州舊金山州立大學(xué)高技術(shù)研究中心進(jìn)修三年。)四十年來(lái)一直從事血細胞生物膜結構與功能及血液病發(fā)病的分子機理及藥物干預等領(lǐng)域的科研和教學(xué)工作。近十幾年來(lái)主要從事腫瘤細胞凋亡與信號轉導及基因表達與調控方面的研究工作。作為課題負責人先后主持國家自然科學(xué)基金,科技部“九五” 攻關(guān)項目,“973”子課題項目等國家級科研項目20余項。在不斷取得研究成果的基礎上,在國內外Cell Death Disease;Free Radical Biology and Medcine;J. Cellular Biochem;  Cancer Letters; Mol Biol Cell;J of Alzheimers Disease;  Apoptosis;等核心雜志上發(fā)表論文140余篇。獲國家教委和衛生部科技進(jìn)步獎三項,發(fā)明專(zhuān)利一項。

楊洋,石磊課題組副主任技師 ,畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué)研究生院。1995年參加工作以來(lái)一直在醫科院基礎醫學(xué)研究所生化及分子生物學(xué)系從事生物膜結構與功能、氧化應激與細胞凋亡、信號轉導以及糖基化修飾與生物學(xué)功能等方面的基礎研究。工作以來(lái)先后參與了科技部“九五” 攻關(guān)項目1項,“973”子課題項目,國家自然科學(xué)基金6項,衛生部自然科學(xué)基金和博士點(diǎn)等共多項國家級和部委級基金。工作以來(lái),在國內外核心期刊雜志上共發(fā)表第一作者中英文學(xué)術(shù)論文6篇,其余署名文章20余篇。

 

4.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

HIV融合機制的研究

國家優(yōu)秀青年科學(xué)基金

130萬(wàn)元

2016

2019

2

VSV G病毒融合蛋白的作用機制研究

國家自然科學(xué)基金面上項目

89 萬(wàn)元

2015

2018

3

丙肝和寨卡等黃病毒的感染與致病機制研究

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程重大協(xié)同創(chuàng )新團隊項目

360萬(wàn)元

2016

2018

 

5.課題組近5年代表性論文

(1) Yali Ci, Kejian Shi, Lei Shi L*, CM Xu*. ROS inhibit autophagy by down-regulating ULK1 mediated by the phosphorylation of P53 in selenite-treated NB4 cells. Cell Death and Disease (2014) 5, e1542; doi:10. 1038/cddis.2014.506.

(2) Kaiyan Hui, Yang Yang, Lei Shi, Caimin Xu*.The p38 MAPK-regulated PKD1/CREB/Bcl-2 pathway contributes to selenite-induced colorectal cancer cell apoptosis in vitro and in vivo. Cancer Lett. 2014 1;354(1):189-199

(3) Yang Y, Luo H, Hui K, Ci Y, Shi K, Chen G, Shi L* , Xu CM*. Selenite-induced autophagy antagonizes apoptosis in colorectal cancer cells in vitro and in vivo. Oncol Rep.2015 Dec 10. doi: 10.3892/or.2015.4484.

(4) Shi L, Shen QT, Alexander Kiel, Wang J, Wang HW, Melia TJ, Rothman JE, Frédéric Pincet. SNARE Proteins: One to Fuse and Three to Keep the Nascent Fusion Pore Open. Science, 2012 Mar 16, 355:1355-1359.

(5) Shi L*, Kevin Howan*, Qingtao Shen, Yong Jian Wang, James E. Rothman, Frédéric Pincet. Preparation and characterization of SNARE-containing nanodiscs and direct study of cargo release through fusion pores. Nature Protocol, 2013 May;8(5):935-48.

 

九、彭小忠課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

本課題組在二十世紀九十年代我國人類(lèi)基因組計劃啟動(dòng)時(shí),應用差異顯示RT-PCR和比較蛋白質(zhì)組學(xué)等分析技術(shù),從不同發(fā)育階段的胎腦及分化前后的神經(jīng)系統腫瘤細胞中分離、克隆到一批新的在神經(jīng)細胞不同發(fā)育或分化階段高表達或特異表達編碼基因的全長(cháng)cDNA。在建立了比較系統的基因結構與功能研究體系的基礎上近幾年對其中部分基因及其編碼的蛋白質(zhì)開(kāi)展了比較系統的結構與功能研究,初步揭示了這些基因的生物學(xué)功能及發(fā)揮生物學(xué)功能的分子機制。近年來(lái)實(shí)驗室主要研究方向為神經(jīng)發(fā)育和疾病發(fā)生的分子機理研究,從基因表達調控的多個(gè)層次上系統研究神經(jīng)系統發(fā)育過(guò)程中神經(jīng)細胞增殖、分化的調控機制和神經(jīng)系統疾病發(fā)生的細胞分子機理,為腦發(fā)育以及腦重大疾病的預警、診斷和治療提供理論基礎。

 

2.課題組負責人介紹

強伯勤院士,現任中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所研究員、北京協(xié)和醫學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)系教授、博士生導師、醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室學(xué)術(shù)委員會(huì )主任1962年畢業(yè)于上海第二醫科大學(xué)醫療系。畢業(yè)后一直在中國醫學(xué)科學(xué)院、北京協(xié)和醫學(xué)院(原中國協(xié)和醫科大學(xué))工作至今。1982-84年,1988-89年,曾以訪(fǎng)問(wèn)學(xué)者身份先后在美國麻省New England Biolabs的分子生物學(xué)實(shí)驗室及芝加哥大學(xué)生物化學(xué)和分子生物學(xué)系工作兩年和一年。1994-1999年期間曾任中國醫學(xué)科學(xué)院副院長(cháng),中國協(xié)和醫科大學(xué)副校長(cháng),并曾任中國協(xié)和醫科大學(xué)基礎醫學(xué)院生物化學(xué)和分子生物學(xué)系學(xué)系主任(1993.1-2007.5)、醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室副主任(1994-2004年) 。曾受聘于國家八六三計劃生物技術(shù)領(lǐng)域專(zhuān)家委員會(huì )成員(1994年-2006)和生物領(lǐng)域首席科學(xué)家(1996-2000年), 以及國家自然科學(xué)基金委生命科學(xué)部主任(1996-2000)。現社會(huì )兼職有國家科技部973計劃顧問(wèn)組專(zhuān)家、中國生物化學(xué)和分子生物學(xué)學(xué)會(huì )醫學(xué)生化與分子生物學(xué)分會(huì )理事長(cháng)、中國醫藥生物技術(shù)協(xié)會(huì )副理事長(cháng)、中華醫學(xué)會(huì )常務(wù)理事、中國生物工程學(xué)會(huì )常務(wù)理事、《中國醫學(xué)科學(xué)院學(xué)報》和《生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展》副主編、國際雜志《Journal of Molecular Medicine》編委等職。

袁建剛研究員,1993-2010年任課題組組長(cháng)。1964-1978年畢業(yè)于北京大學(xué)生物化學(xué)系,獲得學(xué)士學(xué)位并留校任助教;1978-1987年就讀于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生物化學(xué)系,獲得碩士學(xué)位并留所任助研;1987-1992年在美國國立衛生研究所(NIH)任博士后研究人員,客座研究員;1993-2010年回國任中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生物化學(xué)系任副研究員,研究員,博士生導師。2010年退休后經(jīng)所院返聘回所工作。目前作為導師組成員,參與組內科研工作及研究生培養。

 彭小忠研究員,現任課題組組長(cháng)。1983-1988年畢業(yè)于中南大學(xué)湘雅醫學(xué)院(湖南醫科大學(xué))臨床醫學(xué)系并獲醫學(xué)學(xué)士學(xué)位。1988-1991年任中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)生物學(xué)研究所生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究室實(shí)習研究員。1996年就讀于中國協(xié)和醫科大學(xué)微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)并獲理學(xué)博士學(xué)位。1996-2000年在美國紐約州立大學(xué)石溪分校微生物學(xué)和分子遺傳學(xué)系做博士后。2000年至今任中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生物化學(xué)與分子生物學(xué)系副研究員、研究員并先后任碩、博士生導師。2007年入選教育部新世紀人才支持計劃,并擔任“發(fā)育與生殖研究”重大科學(xué)研究計劃項目“非編碼RNA在神經(jīng)和肌肉早期發(fā)育過(guò)程中的功能研究及其體內示蹤的研究”項目首席科學(xué)家。2008年獲國家杰出青年科學(xué)基金項目資助。2010年獲“協(xié)和學(xué)者”特聘教授稱(chēng)號。2013年入選國家百千萬(wàn)人才工程,并被授予“有突出貢獻中青年專(zhuān)家”榮譽(yù)稱(chēng)號。現任中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)靈長(cháng)類(lèi)動(dòng)物研究中心主任,中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)生物學(xué)研究所常務(wù)副所長(cháng)。

 

3.課題組成員介紹

韓為副研究員2012年畢業(yè)于中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所,獲博士學(xué)位,導師強伯勤教授。研究方向:(1)神經(jīng)膠質(zhì)瘤中非編碼RNA與RNA結合蛋白的調控網(wǎng)絡(luò );(2)膠質(zhì)瘤干細胞的自我更新機制和靶向治療。相關(guān)工作發(fā)表于J Clin Invest.(2013),Oncogene(2017)等權威學(xué)術(shù)雜志。近五年來(lái)主持國家自然科學(xué)基金2項,教育部博士點(diǎn)項目1項,院校科研基金3項,參與國家重點(diǎn)研發(fā)計劃1項。

舒鵬程助理研究員,2014年畢業(yè)于北京協(xié)和醫學(xué)院,獲博士學(xué)位,導師彭小忠教授。主要研究方向:神經(jīng)發(fā)育的分子機制。

 

4.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

病毒性疾病的感染組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)平臺建立與應用

重大專(zhuān)項

100

2012

2014

2

IRES在翻譯水平上介導的ADAR1表達上調影響神經(jīng)膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展的機制

國家自然基金面上

80

2014

2017

3

PCBP2和mir-151-5p/mir-16共同調節GhoGDIA表達影響神經(jīng)膠質(zhì)瘤的轉移和侵襲

國家自然基金青年基金

23

2014

2016

4

腦膠質(zhì)瘤多維網(wǎng)絡(luò )調控機制研究與關(guān)鍵節點(diǎn)挖掘

國家重點(diǎn)研發(fā)計劃

50

2016

2018

5

非編碼RNA介導的染色質(zhì)高級結構動(dòng)態(tài)變化對神經(jīng)細胞命運決定的調控功能與分子機制

國家重點(diǎn)研發(fā)計劃

386

2016

2020

6

DTD在小鼠學(xué)習與記憶能力中的作用和機制研究

國家自然基金面上

60

2017

2019

7

粒細胞特質(zhì)表達的長(cháng)鏈非編碼RNA-HOTAIRMA在神經(jīng)膠質(zhì)瘤中的新功能和作用機制研究

國家自然基金面上

60

2017

2019

 

5.課題組近5年代表性論文

(1) Zhou J, Wang R, Zhang J, Zhu L, Liu W, Lu S, Chen P, Li H, Yin B, Yuan J,Qiang B, Shu P, Peng X. Conserved expression of ultra-conserved noncoding RNA in mammalian nervous system. Biochim Biophys Acta. 2017 Dec;1860(12):1159-1168.

(2) Shu P, Fu H, Zhao X, Wu C, Ruan X, Zeng Y, Liu W, Wang M, Hou L, Chen P, YinB, Yuan J, Qiang B, Peng X. MicroRNA-214 modulates neural progenitor cell differentiation by targeting Quaking during cerebral cortex development. Sci Rep. 2017 Aug 14;7(1):8014.

(3) Zhu L, Tan X, Liu W, Mao F, Wu C, Zhou J, Liu X, Lu S, Ma K, Yin B, Luo J,Yuan J, Qiang B, Chen R, Peng X. Identification and analysis of intermediate-sizenoncoding RNAs in the rhesus macaque fetal brain. J Genet Genomics. 2017 Mar20;44(3):171-174.

(4) Hu PS, Xia QS, Wu F, Li DK, Qi YJ, Hu Y, Wei ZZ, Li SS, Tian NY, Wei QF, Shen LJ, Yin B, Jiang T, Yuan JG, Qiang BQ, Han W, Peng XZ. NSPc1 promotes cancer stemcell self-renewal by repressing the synthesis of all-trans retinoic acid via targeting RDH16 in malignant glioma. Oncogene. 2017 Aug 17;36(33):4706-4718.

(5) Wu F, Hu P, Li D, Hu Y, Qi Y, Yin B, Jiang T,Yuan J, Han W, Peng X. RhoGDIαsuppresses self-renewal and tumorigenesis of glioma stem cells. Oncotarget. 2016 Sep 20;7(38):61619-61629.

(6) Lin X, Yang B, Liu W, Tan X, Wu F, Hu P, Jiang T, Bao Z, Yuan J, Qiang B, Peng X, Han W. Interplay between PCBP2 and miRNA modulates ARHGDIA expression and function in glioma migration and invasion. Oncotarget. 2016 Jan 9. doi:10.18632/oncotarget.6869.

(7) Ye F, Xin Z, Han W, Fan J, Yin B, Wu S, Yang W, Yuan J, Qiang B, Sun W, PengX. Quantitative Proteomics Analysis of the Hepatitis C Virus Replicon High-Permissive and Low-Permissive Cell Lines. PLoS One. 2015 Nov 6;10(11):e0142082.

(8) Yang B, Hu P, Lin X, Han W, Zhu L, Tan X, Ye F, Wang G, Wu F, Yin B, Bao Z,Jiang T, Yuan J, Qiang B, Peng X. PTBP1 induces ADAR1 p110 isoform expression through IRES-like dependent translation control and influences cell proliferation in gliomas. Cell Mol Life Sci. 2015 Jun 6..

(9) Yang B, Wang S, Zeng J, Zhang Y, Ruan X, Han W, Yin B, Yuan J, Qiang B, Ying W, Qian X, Peng X. Proteomic screening and identification of microRNA-128 targets in glioma cells. Proteomics. 2015 Mar 17

(10) Han W, Wang L, Yin B, Peng X. Characterization of a novel posttranslational modification in polypyrimidine tract-binding proteins by SUMO1. BMB Rep. 2014 Apr;47(4):233-8.

(11) Zhu Y, Li H, Li K, Zhao X, An T, Hu X, Park J, Huang H, Bin Y, Qiang B, Yuan J, Peng X, Qiu M. Necl-4/SynCAM-4 is expressed in myelinating oligodendrocytes but not required for axonal myelination. PLoS One. 2013 May 20;8(5):e64264.

(12) Han W, Xin Z, Zhao Z, Bao W, Lin X, Yin B, Zhao J, Yuan J, Qiang B, Peng X.RNA-binding protein PCBP2 modulates glioma growth by regulating FHL3. J Clin Invest. 2013 May 1;123(5):2103-18.

(13) Gao X, Yang L, Ma Y, Yang J, Zhang G, Huang G, Huang Q, Chen L, Fu F, Chen Y, Su D, Dong Y, Ma X, Lu C, Peng X. No association of functional variant in pri-miR-218 and risk of congenital heart disease in a Chinese population. Gene.2013 Jul 10;523(2):173-7.

(14) Pan Y, Zhang J, Liu W, Shu P, Yin B, Yuan J, Qiang B, Peng X. Dok5 is involved in the signaling pathway of neurotrophin-3 against TrkC-induced apoptosis.Neurosci Lett. 2013 Aug 14. doi:pii: S0304-3940(13)00725-8.

(15) Li A, Lin X, Tan X, Yin B, Han W, Zhao J, Yuan J, Qiang B, Peng X. Circadian gene Clock contributes to cell proliferation and migration of glioma and is directly regulated by tumor-suppressive miR-124. FEBS Lett. 2013 Aug2;587(15):2455-60.

 

6.課題組近5年專(zhuān)利

聚胞嘧啶結合蛋白2抑制劑在制備治療人神經(jīng)膠質(zhì)瘤的藥物中的用途。彭小忠、韓為、強伯勤、袁建剛ZL.20120100156727.X

 

十、鄭直課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

課題組主要科研領(lǐng)域與方向:(1)將先進(jìn)生物技術(shù)應用于臨床醫學(xué)與診斷,特別是臨床分子診斷新技術(shù)的研究。主要領(lǐng)域包括對傳染病大規模高通量、高靈敏快速篩查所需新技術(shù)的研究,以及適用于精準醫學(xué)及個(gè)性化醫療臨床檢測所需的生物標記物(包括基因突變/SNP、基因表達、甲基化CTC cfDNA、蛋白質(zhì)標記物小分子代謝標記物等)的發(fā)現及其大規模高通量檢測新技術(shù)的研究。課題組已研發(fā)出CLIP-PCR、MELPA等一系列獨創(chuàng )檢測新技術(shù)并已在臨床實(shí)踐中應用。(2)內分泌腫瘤的致病機理研究。課題組利用基因組學(xué)技術(shù)對一種內分泌腫瘤的大量臨床樣品進(jìn)行基因組和表達譜分析,發(fā)現了一個(gè)嶄新的該腫瘤的抑癌基因,在高達70%的散發(fā)性腫瘤中發(fā)生功能缺失,其生物學(xué)功能可解釋大部分散發(fā)性和家族性腫瘤的發(fā)生機制。我們正在進(jìn)一步研究其致病的分子機理,包括其調控機制及其參與的分子調控網(wǎng)絡(luò )和信號通路。課題組成員于2011年、2013年和2015年共3次參加美國臨床化學(xué)學(xué)會(huì )年會(huì ),均獲得當年的"國家臨床生化學(xué)院(NACB)杰出論文摘要獎",其中兩人并獲得國際旅行獎,兩人獲得大會(huì )報告機會(huì ),一人獲得研究生旅行獎及研究生科研獎,兩人還獲得“Pediatric & Maternal-Fetal”分會(huì )最佳摘要獎。課題組成員還曾獲中國全國生物化學(xué)大會(huì )青年科學(xué)家論壇優(yōu)秀報告三等獎。課題組研發(fā)的關(guān)于瘧疾檢測和關(guān)于丙型肝炎檢測的新方法分別成為美國臨床化學(xué)學(xué)會(huì )(AACC)和美國化學(xué)會(huì )(ACS)的新聞發(fā)布內容,并受到近80家美國新聞媒體網(wǎng)站的轉載和報道

 

2.課題組負責人介紹

鄭直研究員,中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所/北京協(xié)和醫學(xué)院基礎學(xué)院教授,儀器中心主任,“協(xié)和學(xué)者”特聘教授。1988年畢業(yè)于北京大學(xué)化學(xué)系。1997年獲美國康奈爾大學(xué)神經(jīng)分子生物學(xué)博士學(xué)位。1997-2000年在美國斯坦福大學(xué)醫學(xué)院血液科作博士后,利用當時(shí)新興的生物芯片技術(shù)研究血液腫瘤的致病機理, 獲醫學(xué)院“院長(cháng)獎學(xué)金”和美國NIH博士后獎學(xué)金(NRSA)。 2000年后在美國生物技術(shù)公司從事基因檢測技術(shù)的創(chuàng )新和開(kāi)發(fā)工作,曾先后結合與應用微顆粒技術(shù),納米熒光材料(量子點(diǎn))及信號擴增等先進(jìn)技術(shù)與材料發(fā)展出多種新型基因檢測手段。領(lǐng)導研發(fā)出的產(chǎn)品被廣泛應用于A(yíng)mgenPfizerJ&J Eli Lilly等制藥公司的研發(fā)工作及臨床實(shí)驗項目中。曾獲美國臨床化學(xué)學(xué)會(huì )(AACC)北加州分會(huì )2007年度"臨床化學(xué)杰出科技貢獻獎"。現為美國臨床化學(xué)學(xué)會(huì )及Alpha Chi Sigma會(huì )員。2007年秋回國工作,2008年獲人事部高層次留學(xué)人才回國資助金。課題組研究工作得到國家自然科學(xué)基金、國家科技重大專(zhuān)項計劃等資助。

 

3.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

重要寄生蟲(chóng)病檢測和檢測技術(shù)研究

重大專(zhuān)項子課題

40

2012

2015

2

乙型肝炎疫苗質(zhì)量控制及評價(jià)研究

重大專(zhuān)項子課題

90

2012

2015

3

直接檢測血液中瘧原蟲(chóng)RNA:高靈敏度高通量分子診斷瘧疾方法的建立和應用研究

國家自然科學(xué)基金面上項目

70

2013

2016

4

高通量核酸檢測新方法研究

協(xié)和學(xué)者基金

100

2015

2018


5.課題組近5年代表性論文

(1) Tian, X, Zhou, J, Zhao, Y., Cheng, Z., Song, W., Sun, Y., Sun, X*., and Zheng, Z*.. High-throughput, Multiplex Genotyping Directly from Blood or Dried Blood Spot without DNA Extraction for the Screening of Multiple G6PD Gene Variants at Risk for Drug-induced Hemolysis, Journal of Molecular Diagnostics 2017, 19: 638-650.

(2) Xu Y and Zheng Z*, Direct RNA detection without nucleic acid purification and PCR: Combining sandwich hybridization with signal amplification based on branched hybridization chain reaction. Biosensors and Bioelectronics. 2016, 79 : 593-599

(3) Cheng Z, Wang D, Tian X, Sun Y, Sun X*, Xiao N*, Zheng Z* Capture Ligation Probe-PCR (CLIP-PCR) for Molecular Screening, with Application to Active Malaria Surveillance for Elimination. Clin Chem. 2015, 61821-8

(4) Tian X, Chen D, Zhang RZhou J, Peng XYang X*, Zhang X*, Zheng Z*, Quantitative survey of multiple CpGs from 5 genes identifies CpG methylation panel discriminating between high- and low-grade cervical intraepithelial neoplasia. Clinical Epigenetics. 2015, 7:4

(5) Mu X*, Xin X, Fan C, Li X, Tian X*, Xu K, Zheng Z*. A paper-based skin patch for the diagnostic screening of cystic fibrosis. Chem Commun 2015, 51:5365.

(6) Mu M*, Zhang L, Chang S, Cui W and Zheng Z*. Multiplex Microfluidic Paper-based Immunoassay for the Diagnosis of Hepatitis C Virus Infection, Analytical Chemistry, 2014, 86: 5338-5344.

(7) Mu X, Liang Q*, Zhou J, Ren K, Hu P, Wang Y, Zheng Z*, Luo G*. “Oil-water biphasic parallel flow for the precise patterning of metals and cells”,Biomed Microdevices, 2014;16(2):245-53

(8) Cheng, Z, Sun, X, Yang, Y, Wang, H and Zheng, Z* "A Novel, Sensitive Assay for High-Throughput Molecular Detection of Plasmodia for Active Screening of Malaria for Elimination" J. Clin. Microbio 2013. 51:125-130

(9) Ran R, Li L*, Wang M, Wang S, Zheng Z*, Lin PP. Determination of EGFR mutations in single cells microdissected from enriched lung tumor cells in peripheral blood. Anal Bioanal Chem. 2013;405(23):7377-82.

 

十一、王曉月課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

課題組研究方向為癌癥基因組學(xué)和生物信息學(xué),主要致力于使用系統生物學(xué)方法研究癌癥的發(fā)生機制并探索可能的療法。一方面通過(guò)整合已有的大量基因組學(xué)和臨床數據,挖掘與癌癥風(fēng)險、癌癥治療相關(guān)的突變位點(diǎn),并研究它們的作用機制;另一方面使用高通量實(shí)驗方法檢測基因-基因間、基因-藥物間相互作用,尋找可能的藥物靶點(diǎn)和治療方法。實(shí)驗室注重新基因組學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)方法的融合,2014建立以來(lái),已形成了一支來(lái)自不同專(zhuān)業(yè)背景的交叉學(xué)科團隊,建成了結合高通量測序技術(shù)、組學(xué)和臨床數據的大規模分析以及細胞模型的完整研究平臺。

 

2.課題組負責人介紹

王曉月研究員,2010年博士畢業(yè)于約翰霍普金斯大學(xué)醫學(xué)院生物化學(xué)系。2010年到2013年在芝加哥大學(xué)基因組學(xué)和系統生物學(xué)研究所進(jìn)行博士后研究。2014年被聘為“協(xié)和學(xué)者”特聘教授。現任基礎醫學(xué)研究所生物信息中心主任,課題組隸屬于醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室。

 

3.課題組成員介紹

梁俊波助理研究員,2011年畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué),獲博士學(xué)位,導師王琳芳教授。主要研究方向為癌癥基因組學(xué)與生物信息學(xué)。參與相關(guān)工作發(fā)表于 Genome Biol(2017)等學(xué)術(shù)期刊。目前承擔國家自然科學(xué)基金青年基金項目資助(項目號:81502420;2016-2018,19.8萬(wàn)元)。

 

4.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

通過(guò)系統檢測基因間相互作用探索癌癥基因功能

國家自然科學(xué)基金面上項目

80

2015

2018

2

極端條件與有害環(huán)境因子引發(fā)的心理、病理及生理改變機制的研究

中 國 醫 學(xué) 科 學(xué) 院中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費

200

2016

2017

3

肝膽惡性腫瘤精準治療靶點(diǎn)的高通量篩選與驗證

中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程協(xié)同創(chuàng )新項目

840

2017

2020

 

5.課題組近5年代表性論文

(1) Liu S., Liu Y., Zhang Q., Wu J., Liang J., Yu S., Wei G.H., White K.P. and Wang X. 2017. Systematic identification of regulatory variants associated with cancer risk. Genome Biology.18:194.

(2) Zhang W., He H., Zang M., Wu Q, Zhao H., Lu L.L., Ma P., Zheng H., Wang N., Zhang Y., He S., Chen X., Wu Z., Wang X., Cai J., Liu Z., Sun Z., Zeng Y.X., Qu C. and Jiao Y. 2017. Genetic features of aflatoxin-associated hepatocellular carcinomas. Gastroenterology. (17):30333-5.

(3) Xue Y., Lameijer E.W., Ye K., Zhang K., Chang S., Wang X., Wu J., Gao G., Zhao F., Li J., Han C., Xu S., Xiao J., Yang X., Ying X., Zhang X., Chen W.H., Liu Y., Zhang Z., Huang K. and Yu J. 2016. Precision medicine: What Challenges are we facing? Genomics Proteomics Bioinformatics. (16) 30140-1.

(4) Huang D.S., Tao H.Q., He X.J., Long M., Yu S., Xia Y.J., Wei Z., Xiong Z., Jones S., He Y.P., Yan H. and Wang X. 2015. Prevalence of deleterious ATM germline mutations in gastric cancer patients. Oncotarget. 6(38):40953.

(5) Wang X., Fu Q.A., McNerney M.E. and White K.P. 2014. Widespread genetic epistasis among cancer genes. Nature Communications 5:4828.

(6) McNerney M.E., Brown C.D., Wang X., Bartom E.T., Karmakar S., Bandlamudi C., Yu S., Stricker T., Anastasi J., Vardiman J.M., Le Beau M.M. and White K.P. 2013. CUX1 is a haploinsufficient tumor suppressor gene on chromosome 7 frequently inactivated in acute myeloid leukemia. Blood 121(6):975-983.

 

十二、張勇課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

經(jīng)典的生物化學(xué)研究認為細胞代謝的重要功能是為細胞的基本活動(dòng)提供物質(zhì)基礎和能量保證,而忽略了生物體代謝的信息傳遞作用。近年來(lái)生命科學(xué)的研究對細胞代謝的認識有了新的突破,即機體代謝的功能不僅僅是為細胞活動(dòng)提供物質(zhì)和能量,更為重要的是細胞代謝中的代謝產(chǎn)物(特別是代謝中產(chǎn)物小分子,intermediate metabolites)和代謝酶可能具有十分重要的信號轉導功能。探討細胞代謝與細胞活動(dòng)之間的信號轉導聯(lián)系已成為生命科學(xué)中最具有挑戰性的熱點(diǎn)研究領(lǐng)域之一。因此,發(fā)現和揭示這些具有細胞信號轉導功能的酶和相應的代謝小分子在調控各種生命現象中的功能與分子機制將為解釋生命的起源、進(jìn)化、發(fā)育和疾病發(fā)生發(fā)展等各種基本生命現象和過(guò)程的本質(zhì)提供最為基本的物質(zhì)和信息基礎。 
    骨骼肌作為機體最大的代謝內分泌器官在維持機體代謝穩態(tài)平衡中起著(zhù)十分重要的調控功能。更有趣的是,骨骼肌成體干細胞位于骨骼肌纖維(Myofibers)的基底膜上。基于以上結果,本課題組正在利用骨骼肌代謝作為研究系統,探討“骨骼肌代謝微環(huán)境(metabolic niche of myofibers)對骨骼肌干細胞功能和機體整體代謝穩態(tài)調控的作用及分子機制”。這是本課題組自2003年由朱大海教授組建以來(lái)始終致力于探究的科學(xué)問(wèn)題。在此研究系統下,本課題組研究的切入點(diǎn)是非編碼RNA和小分子代謝中間產(chǎn)物在調控骨骼肌代謝微環(huán)境、骨骼肌干細胞功能異質(zhì)性和機體代謝穩態(tài)調控中的功能及其分子機制。同時(shí),為了更深入的揭示細胞代謝對基因表達調控的表觀(guān)遺傳學(xué)機制,本課題組正在利用Hi-C、RNA-Seq和ChIP-Seq等各種高通量測序和生物信息等系統性研究手段,用整合生物學(xué)的觀(guān)點(diǎn)從染色質(zhì)高級結構動(dòng)態(tài)變化角度解析所研究的調控因子發(fā)揮生理和病理功能的分子機制。 
    本課題組有明確和具有挑戰性的科學(xué)問(wèn)題,前沿和成熟的技術(shù)平臺和研究經(jīng)費的支持(朱大海教授作為首席科學(xué)家主持的科技部干細胞及轉化研究重點(diǎn)專(zhuān)項項目“非編碼 RNA 介導的染色質(zhì)高級結構動(dòng)態(tài)變化對骨骼肌細胞譜系命運決定的調控作用及分子機制;張勇教授主持的科技部973項目“骨骼肌與脂肪細胞轉換關(guān)鍵因子的鑒定及功能”;朱大海教授主持的國家自然基金委重點(diǎn)項目“骨骼肌特異表達Linc-RAM在骨骼肌細胞譜系建立中的功能”和面上項目“代謝小分子乙酰乙酸以信號分子方式調控骨骼肌再生與骨骼肌疾病的功能與分子機制”;張勇教授主持的自然基金委項目“MyoD結合的骨骼肌特異長(cháng)非編碼RNA(Linc-MCD)調控MyoD功能的分子機制”;以及中國醫學(xué)科學(xué)院醫學(xué)與健康科技創(chuàng )新工程項目)。 
    本課題組在非編碼RNA研究方面,從骨骼肌特異表達非編碼RNA的系統鑒定(Nucleic Acids Res. 2009,BMC Genomics. 2010, 2011),到非編碼RNA調控骨骼肌干細胞異質(zhì)性功能及分子機制(Nature Commun. 2015, 2017,Cell Death Dis, 2017)已取得了一些原創(chuàng )性的研究成果。特別是在長(cháng)非編碼RNA方面,采用生物信息學(xué)方法發(fā)現鑒定了一個(gè)受MyoD調控在骨骼肌細胞中特異表達的長(cháng)非編碼Linc-RAM(Long intergenic ncRNA of Activator of Myogenesis), 利用Linc-RAM敲除小鼠在整體動(dòng)物水平發(fā)現了Linc-RAM在調控骨骼肌細胞譜系命運決定和分化中的功能,解析了Linc-RAM通過(guò)直接結合MyoD介導表觀(guān)遺傳調控復合物MyoD/Baf60c/Brg1的組裝進(jìn)而調節肌細胞分化相關(guān)基因的表達的分子機制(Nature commun.2017)。 
    在細胞代謝的調控功能與分子機制方面,本課題組首次揭示了小分子代謝中間產(chǎn)物乙酰乙酸作為信號分子調控骨骼肌干細胞的激活、增殖與分化的新功能和新的分子機制(J Biol Chem. 2016);更為有趣的是,骨骼肌中磷酸烯醇式丙酮酸-丙酮酸無(wú)效循環(huán)(Futile cycle)代謝途徑對脂肪組織中脂肪酸代謝的調控功能,揭示了該無(wú)效循環(huán)介導的骨骼肌和脂肪組織間相互作用(Inter-organ communication)對維持小鼠整體代謝穩態(tài)的調控功能(EBioMedicine. 2016)。EBioMedicine當期發(fā)表評論文章指出:“本研究在整體動(dòng)物水平上,首次發(fā)現代謝通路中的無(wú)效循環(huán)(Futile cycle)在維持機體能量代謝穩態(tài)中的調控功能及其分子機制”。同時(shí),本課題組還首次揭示了骨骼肌分泌因子Myostatin通過(guò)激活AMPK促進(jìn)糖酵解調節骨骼肌組織糖代謝(Int J Biochem Cell Biol. 2010),以及以旁分泌方式通過(guò)調控腫瘤細胞代謝的機制誘導腫瘤細胞凋亡(Cell Death Dis. 2013)。最近的研究表明,Myostatin基因敲除小鼠骨骼肌組織中表達上調的miR-30e調控酵解型肌纖維的形成和代謝(Acta Biochim Biophys Sin. 2017),可能是Myostatin調控機體代謝穩態(tài)平衡的機制之一。這些研究結果揭示了骨骼肌分泌的細胞因子在調控細胞能量代謝和疾病方面發(fā)揮非常重要的調控功能。在Myostatin發(fā)揮功能的分子機制研究方面本課題組鑒定了三條信號轉導通路(Cancer Res. 2006;J Biol Chem. 2007;Cellular Signalling,2008)。

 

2.課題組負責人介紹

張勇研究員, 1994年哈爾濱師范大學(xué)生物系獲學(xué)士學(xué)位,1997年哈爾濱醫科大學(xué)獲遺傳學(xué)碩士學(xué)位,2004年獲哈爾濱醫科大學(xué)醫學(xué)遺傳學(xué)專(zhuān)業(yè)博士學(xué)位。2004~2006年在中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所從事博士后研究,博士后出站留所工作。現任中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所、醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室研究員。承擔研究生的發(fā)育生物學(xué)、細胞生物基礎及超微結構的分子生物學(xué)、經(jīng)典英文文獻閱讀技巧等課程教學(xué)。中國細胞生物學(xué)會(huì )發(fā)育生物學(xué)分會(huì )會(huì )員,北京市細胞生物學(xué)會(huì )會(huì )員,北京市生理學(xué)會(huì )生化與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )會(huì )員。

張勇博士所在研究組長(cháng)期從事骨骼肌干細胞生物學(xué)與骨骼肌代謝的調控功能及分子機制研究。主要研究興趣包括:骨骼肌成體干細胞對骨骼肌組織損傷再生、肌營(yíng)養不良和肌少癥的調控功能與分子機制;染色質(zhì)高級結構動(dòng)態(tài)變化調控骨骼肌細胞譜系命運決定與分化的分子機制;骨骼肌代謝對機體代謝穩態(tài)的調控功能與分子機制。特別是,目前主要集中于探討骨骼肌代謝調控的分泌因子以旁分泌的方式調控骨骼肌成體干細胞的功能及其對肌營(yíng)養不良和肌少癥病理發(fā)生的調控、骨骼肌代謝調控的肌纖維分泌因子以?xún)确置诜绞綄φ麄€(gè)機體代謝穩態(tài)的調控及其分子機制。期望為肌營(yíng)養不良、肌少癥和代謝綜合征等肌肉相關(guān)性疾病的治療提供理論基礎和藥物靶點(diǎn)。先后主持多項國家和部級科研課題,包括國家自然科學(xué)基金面上項目2項、國家自然科學(xué)基金重大科學(xué)研究計劃培育項目1項,科技部973課題2項。作為副組長(cháng)主持863課題2項、作為骨干參加國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目1項。發(fā)表SCI研究論文近30篇。

她們研究組在非編碼RNA和小分子代謝中間產(chǎn)物調控骨骼肌干細胞功能及其分子機制方面取得了一些原創(chuàng )性的成果:系統鑒定了一批骨骼肌組織中表達的非編碼RNA(Nucleic Acids Res. 2009;BMC Genomics. 2010;BMC Genomics. 2011);采用轉基因和遺傳示蹤系統(Rosa26mTmG)揭示了小分子非編碼RNA(miR-431)調控骨骼肌成體干細胞異質(zhì)性建立和維持的分子機制(Nat Commun. 2015);揭示了小分子代謝中間產(chǎn)物乙酰乙酸作為信號分子調控骨骼肌干細胞的激活、增殖與分化的新功能和新的分子機制(J Biol Chem. 2016);闡明了骨骼肌組織高豐度表達的小分子非編碼RNA(miR-127)通過(guò)靶向鞘氨醇受體S1PR3調控骨骼肌干細胞分化促進(jìn)骨骼肌損傷再生緩解肌營(yíng)養不良病理表型(Cell Death Dis, 2017);發(fā)現和證明了一個(gè)骨骼肌特異表達與MyoD相結合的長(cháng)非編碼Linc-RAM在調控骨骼肌細胞譜系命運決定和分化中的功能,解析了其發(fā)揮功能的分子機制:Linc-RAM直接結合MyoD介導表觀(guān)遺傳調控復合物MyoD/Baf60c/Brg1的組裝進(jìn)而調節肌細胞分化相關(guān)基因的表達Nat Commun. 2017)。在骨骼肌代謝調控方面,她們采用轉基因小鼠模型揭示了骨骼肌中磷酸烯醇式丙酮酸-丙酮酸無(wú)效循環(huán)(Futile cycle)對脂肪組織中脂肪酸代謝的調控功能,發(fā)現了該無(wú)效循環(huán)介導的骨骼肌和脂肪組織間相互作用(Inter-organ communication)對維持小鼠整體代謝穩態(tài)的調控功能(EBioMedicine. 2016)。EBioMedicine當期發(fā)表評論文章指出:“本研究在整體動(dòng)物水平上,首次發(fā)現代謝通路中的無(wú)效循環(huán)(Futile cycle)在維持機體能量代謝穩態(tài)中的調控功能及其分子機制。”

 

3.課題組主要科研項目

序號

項目名稱(chēng)

項目性質(zhì)及來(lái)源

項目經(jīng)費

起始年度

終止年度

1

骨骼肌特異表達Linc-RAM在骨骼肌細胞譜系建立中的功能

國家自然科學(xué)基金重大研究計劃

344

2016

2019

2

代謝小分子乙酰乙酸以信號分子方式調控骨骼肌再生與骨骼肌疾病的功能與分子機制

國家自然科學(xué)基金面上項目

85

2015

2018

3

非編碼 RNA 介導的染色質(zhì)高級結構動(dòng)態(tài)變化對骨骼肌細胞譜系命運決定的調控作用及分子機制

科技部國家重點(diǎn)研發(fā)干細胞與轉化研究專(zhuān)項

534

2016

2020

4

MyoD結合的骨骼肌特異長(cháng)非編碼RNA(Linc-MCD)調控MyoD功能的分子機制

國家自然科學(xué)基金面上項目

85

2015

2018

5

骨骼肌與脂肪細胞轉換關(guān)鍵因子的鑒定及功能

科技部973

300

2015

2019

 

4.課題組近5年代表性論文

(1) Xiaohua Yu#, Yong Zhang#*, Tingting Li, Zhao Ma, Haixue Jia, Qian Chen, Yixia Zhao, Lili Zhai, Ran Zhong, Changyin Li, Xiaoting Zou, Jiao Meng, Antony K. Chen, Pier Lorenzo Puri, Meihong Chen, and Dahai Zhu*. Long non-coding RNA Linc-RAM enhances myogenic differentiation by interacting with MyoD. Nat Commun. 2017. Jan 16;8:14016.

(2) Lili Zhai, Rimao Wu, Wanhong Han, Yong Zhang* and Dahai Zhu*. miR-127 promotes myogenic cell differentiation by targetingS1PR3. Cell Death Dis. 2017. Mar 30;8(3):e2707. doi: 10.1038/cddis.2017.128.

(3) Haixue Jia#, Yixia Zhao#, Tingting Li, Yong Zhang*, Dahai Zhu*. miR-30e is negatively regulated by myostatin in skeletal muscle and is functionally related to fiber-type composition. Acta Biochim Biophys Sin. 2017. Mar 17:1-8. doi: 10.1093/abbs/gmx019. [Epub ahead of print]

(4) Yue Fan, Ying Zhang, Rimao Wu, Xingming Chen, Yong Zhang*, Xiaowei Chen*, Dahai Zhu. miR-431 is involved in regulating cochlear function by targeting Eya4. BBA - Molecular Basis of Disease. 2016 Nov;1862(11):2119-2126. doi: 10.1016/j.bbadis.2016.08.015. Epub 2016 Aug 19.

(5) Ping Zeng, Wanhong Han, Changyin Li, Hu Li, Dahai Zhu, Yong Zhang*, Xiaohong Liu*. miR-378 attenuates muscle regeneration by delaying satellite cell activation and differentiation in mice. Acta Biochim Biophys Sin. 2016 Sep;48(9):833-9. doi: 10.1093/abbs/gmw077. Epub 2016 Aug 25.

(6) Yong Zhang, Changyin Li, Hu Li, Yipeng Song, Yixia Zhao, Lili Zhai, Haixia Wang, Ran Zhong, Huiru Tang, and Dahai Zhu*. miR-378 Activates the Pyruvate-PEP Futile Cycle and Enhances Lipolysis to Ameliorate Obesity in Mice. EBioMedicine. 2016. Mar 11;5:93-104.

(7) Xiaoting Zou, Jiao Meng, Li Li, Wanhong Han, Changyin Li, Ran Zhong, Xuexia Miao, Jun Cai, Yong Zhang* and Dahai Zhu*. Acetoacetate accelerates muscle regeneration and ameliorates muscular dystrophy in mice. J Biol Chem. 2016 Jan 29;291(5):2181-95. Epub 2015 Dec 8.

(8) Rimao Wu, Hu Li, Lili Zhai, Xiaoting Zou, Jiao Meng, Ran Zhong, Changyin Li, Haixia Wang, Yong Zhang*, Dahai Zhu*. MicroRNA-431 accelerates muscle regeneration and ameliorates muscular dystrophy by targeting Pax7 in mice. Nat Commun. 2015 Jul 7;6:7713. doi: 10.1038/ncomms8713.

(9) He Cheng, Audi Wang, Jiao Meng, Yong Zhang, Dahai Zhu*. Enhanced metastasis in RNF13 knockout mice is mediated by a reduction in GM-CSF levels. Protein & Cell, 2015 Oct;6(10):746-56.

(10) Rimao Wu, Hu Li, Tingting Li, Yong Zhang*, Dahai Zhu*. Myostatin regulates miR-431 expression via the Ras-Mek-Erk signaling pathway. Biochem Biophys Res Commun. 2015 May 29;461(2):224-9. doi: 10.1016/j.bbrc.2015.03.150. Epub 2015 Apr 11.

(11) Jiao Meng, Xiaoting Zou, Rimao Wu, Ran Zhong, Dahai Zhu* and Yong Zhang*. Accelerated Regeneration of Skeletal Muscle in RNF13-Knockout Mice is Mediated by Macrophage-Secreted IL-4/IL-6. Protein & Cell, 2014 Mar;5(3):235-247.

(12) Yong Liu, He Cheng, Yuchang Zhou, Yushan Zhu, Rui Bian, Yuewen Chen, Changyin Li, Qi Ma, Qiaoxia Zheng, Yong Zhang, Haijing Jin, Xiaohui Wang, Quan Chen, Dahai Zhu*. Myostatin induces mitochondrial metabolic alteration and typical apoptosis in cancer cells. Cell Death Dis. 2013 Feb 14;4:e494.

(13) Qiang Zhang, Yanfeng Li, Lei Zhang, Nan Yang, Jiao Meng, Pingping Zuo, Yong Zhang, Jie Chen, Li Wang, Xiang Gao, Dahai Zhu*. E3 ubiquitin ligase RNF13 involves spatial learning and assembly of the SNARE complex. Cell Mol Life Sci. 2013 Jan;70(1):153-65. Epub 2012 Aug 14

(14) Yao Song, Jialin Xu, Yanfeng Li, Chunshi Jia, Xiaowei Ma, Lei Zhang, Xiaojie Xie, Yong Zhang, Xiang Gao, Youyi Zhang, Dahai Zhu*. Cardiac Ankyrin Repeat Protein Attenuates Cardiac Hypertrophy by Inhibition of ERK1/2 and TGF-b Signaling Pathways. PLoS One. 2012;7(12):e50436. Epub 2012 Dec 5.

(15) Tingting Li, Suya Wang, Rimao Wu, Xueya Zhou, Dahai Zhu*, Yong Zhang*. Identification of long non-protein coding RNAs in chicken skeletal muscle using next generation sequencing. Genomics, 2012 May;99(5):292-8. Epub 2012 Feb 20.

 

5.課題組近5年專(zhuān)利

(1)肌肉生長(cháng)抑制素在制備抗腫瘤藥物中的應用發(fā)明人:邊睿,趙相軒,劉泳,朱大海,陳佺專(zhuān) 利 號:ZL 2006 1 0089106.9

(2)一個(gè)人指環(huán)蛋白及其編碼基因與應用發(fā)明人:張強,孟云霄,張蕾,王鵬,陳杰,劉彤華,朱大海專(zhuān) 利 號:ZL 2006 1 0112480.6

(3)miR-431在制備治療肌肉疾病的藥物中的用途發(fā)明人:朱大海,武日茂,翟麗麗,張勇專(zhuān) 利 號:ZL 2014 1 0496029.3

 

十三、于洋課題組

1.課題組簡(jiǎn)介

本課題組建立于2019年,實(shí)驗室綜合利用分子生物學(xué)、生物化學(xué)、細胞生物學(xué)、小鼠遺傳學(xué)、生物信息學(xué)手段,研究神經(jīng)發(fā)育過(guò)程中基因表達的轉錄調控和轉錄后調控機制。具體而言,我們關(guān)注以下問(wèn)題:(1)神經(jīng)發(fā)育相關(guān)的基因如何被轉錄激活和抑制;(2)這些基因在轉錄成RNA之后如何被識別、監測和調控;(3)這些精巧的生物學(xué)過(guò)程如何限定在特定亞神經(jīng)細胞結構內(例如軸突或突觸)內發(fā)生;(4)在異常狀態(tài)下(例如腫瘤),神經(jīng)基因會(huì )在其他組織中表達、修飾、并引發(fā)嚴重疾病(如副腫瘤綜合征),那么病變的細胞內基因調控發(fā)生了哪些缺陷才導致神經(jīng)基因的異位表達?

 

2.課題組負責人介紹

于洋,男,醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室PI。2014年獲得四川大學(xué)華西醫學(xué)院生化與分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)理學(xué)博士學(xué)位。2014-2019年在美國紀念斯隆凱特琳癌癥中心(MSKCC Eric Lai實(shí)驗室進(jìn)行博士后研究工作。2019年六月作為人才引進(jìn)加入中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所生化系、醫學(xué)分子生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室工作。

 

3.課題組成員

管理與技術(shù)人員    郭蓉 (guorong329@@126.com)

                      牛栗潔 (lijie_niu@@yeah.net)

研究生與實(shí)習生    潘安宇,2020級博士研究生

                      曾揚帆,2019級碩士研究生

                      劉靜靜,2019級碩士研究生

 周夢(mèng)杰,2020級碩士研究生

 

4.課題組代表性論文

(1) Yu, Y.#, Andreu-Agullo, C., Liu, B., Barboza, L., Toth, M., Lai, E#. (2020). Regulation of embryonic and adult neurogenesis by Ars2. Development 147:dev180018. (#Co-corresponding author). PMID: 31969356.

(2) Yu, Y.*, Chen, Y.*, Kim, B.*, Wang H, Zhao C, He X, Liu L, Liu W, Wu LM, Mao M, Chan JR, Wu J, Lu QR. (2013). Olig2 targets chromatin remodelers to enhancers to initiate oligodendrocyte differentiation. Cell 152, 248-261. (*Co-first author). PMID: 23332759.

(3) Wang JJ, Lee J., Riemondy K., Yu Y, Marquez S., Lai E., and Yi R (2020). XPO5 promotes primary miRNA processing independently of RanGTP. Nature Communications

(4) Lv X, Ren SQ, Zhang XJ, Shen Z, Ghosh T, Xianyu A, Gao P, Li Z, Lin S, Yu Y, Zhang Q, Groszer M, Shi SH (2019). TBR2 coordinates neurogenesis expansion and precise microcircuit organization via Protocadherin 19 in the mammalian cortex. Nature Communications 10, 3946. PMID: 31477701.

(5) He X, Zhang L, Chen Y, Remke M, Shih D, Lu F, Wang H, Deng Y, Yu Y, Xia Y, Wu X, Ramaswamy V, Hu T, Wang F, Zhou W, Burns DK, Kim SH, Kool M, Pfister SM, Weinstein LS, Pomeroy SL, Gilbertson RJ, Rubin JB, Hou Y, Wechsler-Reya R, Taylor MD, Lu QR (2014). The G protein α subunit Gαs is a tumor suppressor in Sonic hedgehog-driven medulloblastoma. Nature Medicine 20, 1035-1042. PMID:25150496

(6) He, X*., Yu, Y*., Awatramani, R., and Lu, Q.R. (2012). Unwrapping myelination by microRNAs. The Neuroscientist 18, 45-55. (*Co-first author, Review)

(7) Yu, Y., Casaccia, P., and Lu, Q.R. (2010). Shaping the oligodendrocyte identity by epigenetic control. Epigenetics 5, 124-128. (Review)

(8) Zhao X, He X, Han X, Yu Y, Ye F, Chen Y, Hoang T, Xu X, Mi QS, Xin M, Wang F, Appel B, Lu QR. (2010). MicroRNA-mediated control of oligodendrocyte differentiation. Neuron 65, 612-626. PMID: 20223198.