石磊，中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所、北京協(xié)和醫學(xué)院 “協(xié)和學(xué)者”特聘教授，博士生導師。2001年畢業(yè)于武漢大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，獲學(xué)士學(xué)位，2006年畢業(yè)于中國協(xié)和醫科大學(xué)基礎醫學(xué)研究所生化及分子生物學(xué)專(zhuān)業(yè)，獲博士學(xué)位。2007-2012年在耶魯大學(xué)、紐約大學(xué)進(jìn)行博士后研究，2014回國加入基礎所工作，獲國自然基金委“優(yōu)青”基金、面上基金、科技部重點(diǎn)研發(fā)計劃項目支持，并獲2015年度“求是杰出青年學(xué)者獎”。擔任中國生物物理學(xué)會(huì )生物膜生物學(xué)專(zhuān)業(yè)分會(huì )理事。近年來(lái)一直從事膜蛋白的功能與機制、囊膜病毒感染復制的相關(guān)研究。

郵箱： shilei@ibms.pumc.edu.cn 

實(shí)驗室介紹

本實(shí)驗室1978年由潘華珍教授創(chuàng )建，主要研究膜脂膜蛋白相互作用分子機理及紅細胞膜異常的血液病分子機理研究。1993年許彩民教授接課題組后繼續此方向的研究，同時(shí)開(kāi)始進(jìn)行腫瘤細胞凋亡與信號轉導及基因表達與調控方面的研究，取得了良好的研究進(jìn)展，發(fā)表了一系列的SCI學(xué)術(shù)研究論文。2014年石磊教授接任課題組長(cháng)，繼續開(kāi)展膜蛋白和生物膜相關(guān)研究，目前實(shí)驗室關(guān)注真核細胞器的動(dòng)態(tài)變化與功能、細胞器的互作以及疾病狀況（如病毒感染或其他疾病）和藥物作用下細胞器的形態(tài)與功能變化。

課題組人員： 

慈雅麗，博士，副研究員。

楊洋，碩士，副主任技師。

許彩民（返聘）,研究員(教授)，博士生導師。畢業(yè)于北京大學(xué)化學(xué)系。1974年以來(lái)一直在中國醫學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所工作（其中，1987-1990年在美國北加州舊金山州立大學(xué)高技術(shù)研究中心進(jìn)修三年。）四十年來(lái)一直從事血細胞生物膜結構與功能及血液病發(fā)病的分子機理及藥物干預等領(lǐng)域的科研和教學(xué)工作。近十幾年來(lái)主要從事腫瘤細胞凋亡與信號轉導及基因表達與調控方面的研究工作。作為課題負責人先后主持國家自然科學(xué)基金，科技部“九五” 攻關(guān)項目， “973”子課題項目等國家級科研項目20余項。在不斷取得研究成果的基礎上，在國內外Cell Death Disease；Free Radical Biology and Medcine；J. Cellular Biochem;  Cancer Letters； Mol Biol Cell；J of Alzheimers Disease;  Apoptosis；等核心雜志上發(fā)表論文140余篇。獲國家教委和衛生部科技進(jìn)步獎三項，發(fā)明專(zhuān)利一項。

代表性文章:

1. 1. Flavivirus Concentrates Host ER in Main Replication Compartments to Facilitate Replication. Ci Y^#, Han K, Kong J, Huang S, Yang Y, Qin CF, Shi L^#.  Adv Sci (Weinh). 2023 Dec;10(36):e2305093.

   2. Bortezomib inhibits ZIKV/DENV by interfering with viral polyprotein cleavage via the ERAD pathway.  Ci Y, Yao B, Yue K, Yang Y, Xu C, Li DF, Qin CF, Shi L^#. Cell Chem Biol. 2023 May 18;30(5):527-539.e5.

   3. A novel fluorescent endoplasmic reticulum marker for super-resolution imaging in live cells.Han K, Huang S, Kong J, Yang Y, Shi L^#, Ci Y^#.   FEBS Lett. 2023 Mar;597(5):693-701. (Cover Story)

   4. Exploration of the Shared Molecular Mechanisms between COVID-19 and neurodegenerative diseases through Bioinformatic Analysis. Shi Y, Liu W, Yang Y, Ci Y, Shi L^#. Int J Mol Sci. 2023 Mar 2;24(5):4839.

   5. The stalk domain of SARS-CoV-2 NSP13 is essential for its helicase activity.  Yue K, Yao B, Shi Y, Yang Y, Qian Z, Ci Y^#, Shi L^#. Biochem Biophys Res Commun. 2022 Apr 23;601:129-136.

   6. Compartmentalized replication organelle of flavivirus at the ER and the factors involved. (Review) Ci Y^#, Shi L^#. Cell Mol Life Sci. 2021 Jun;78(11):4939-4954.  (Review)

   7. Zika NS1–induced ER remodeling is essential for viral replication.  Yali Ci, ZhongYu Liu, NaNa Zhang, Yuqiang Niu, Yang Yang, Caimin Xu, Wei Yang^#, ChengFeng Qin^#, and Lei Shi^#. J. Cell Biol. 2020 Feb 3;219(2): e201903062.  

   8. Zika virus NS3 is a canonical RNA helicase stimulated by NS5 RNA polymerase.  Shan Xu, Yali Ci, Leijie Wang, Yang Yang, Leiliang Zhang , Caimin Xu Chengfeng Qin and Lei Shi^#. Nucleic Acids Research. 2019, Vol. 47, No. 16 8693–8707. 

   9. Zika NS2B is a crucial factor recruiting NS3 to the ER and activating its protease activity. Huaipeng Xing, Shan Xu, Fangfei Jia, Yang Yang, Caimin Xu, Chengfeng Qin^#，Lei Shi^#.  Virus Research. 275 (2020) 197793.

   10. Vesicular stomatitis virus G protein transmembrane region is crucial for the hemi-fusion to full fusion transition.  Yali Ci, Yang Yang, Caimin Xu, Lei Shi^#. Sci Rep. 2018 Jul 13;8(1):10669.

   11. ROS inhibit autophagy by downregulating ULK1 mediated by the phosphorylation of p53 in selenite-treated NB4 cells. Ci Y, Shi K, An J, Yang Y, Hui K, Wu P, Shi L^#, Xu C^#.Cell Death Dis. 2014 Nov 27;5:e1542.

   12. Selenite-induced autophagy antagonizes apoptosis in colorectal cancer cells in vitro and in vivo.  Yang Y, Luo H, Hui K, Ci Y, Shi K, Chen G, Shi L^#, Xu CM^#.Oncol Rep. 2015 Dec 10. doi: 10.3892/or.2015.4484.

   13. SNARE Proteins: One to Fuse and Three to Keep the Nascent Fusion Pore Open.  Shi L, Shen QT, Alexander Kiel, Wang J, Wang HW, Melia TJ, Rothman JE, Frédéric Pincet.      Science. 2012 Mar 16, 355:1355-1359. (由美國《科學(xué)家》雜志（The Scientist）報道，并被Faculty 1000推薦)

   14. Preparation and characterization of SNARE-containing nanodiscs and direct study of cargo release through fusion pores.  Shi L*, Kevin Howan*, Qing-tao Shen, Yong Jian Wang, James E. Rothman, Frédéric Pincet. Nature Protocols. 2013 May;8(5):935-48. ( * these authors contribute equally).

   15. Dual roles of Munc18-1 rely on distinct binding modes of the central cavity with Stx1A and SNARE complex.  Shi L, Kümmel D, Coleman J, Melia TJ, Giraudo CG. Mol Biol Cell. 2011 Nov;22(21):4150-60.

   16. Downstream of tyrosine kinase/docking protein 6, as a novel substrate of tropomyosin-related kinase C receptor, is involved in neurotrophin 3-mediated neurite outgrowth in mouse cortex neurons.   Li W*, Shi L*, You Y, Gong Y, Yin B, Yuan J, Peng X.BMC Biol. 2010 Jun 18;8:86. ( * these authors contribute equally).

   17. Dok5 is substrate of TrkB and TrkC receptors and involved in neurotrophin induced MAPK activation.  Shi L, Yue J, You Y, Yin B, Gong Y, Xu C, Qiang B, Yuan J, Liu Y, Peng X.Cell Signal. 2006 Nov;18(11):1995-2003.